Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPOCK3Q9BQ16 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPOCK3Q9BQ16 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPOCK3Q9BQ16 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPOCK3Q9BQ16 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SPOCK3Q9BQ16 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPOCK3Q9BQ16 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPOCK3Q9BQ16 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPOCK3Q9BQ16 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPOCK3Q9BQ16 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPOCK3Q9BQ16 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPOCK3Q9BQ16 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPOCK3Q9BQ16 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPOCK3Q9BQ16 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPOCK3Q9BQ16 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPOCK3Q9BQ16 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPOCK3Q9BQ16 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOCK3Q9BQ16 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOCK3Q9BQ16 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOCK3Q9BQ16 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOCK3Q9BQ16 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOCK3Q9BQ16 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOCK3Q9BQ16 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOCK3Q9BQ16 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOCK3Q9BQ16 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPOCK3Q9BQ16 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOCK3Q9BQ16 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPOCK3Q9BQ16 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOCK3Q9BQ16 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOCK3Q9BQ16 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPOCK3Q9BQ16 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPOCK3Q9BQ16 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPOCK3Q9BQ16 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPOCK3Q9BQ16 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPOCK3Q9BQ16 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPOCK3Q9BQ16 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPOCK3Q9BQ16 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPOCK3Q9BQ16 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPOCK3Q9BQ16 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPOCK3Q9BQ16 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPOCK3Q9BQ16 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPOCK3Q9BQ16 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPOCK3Q9BQ16 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPOCK3Q9BQ16 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOCK3Q9BQ16 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOCK3Q9BQ16 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPOCK3Q9BQ16 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPOCK3Q9BQ16 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPOCK3Q9BQ16 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPOCK3Q9BQ16 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPOCK3Q9BQ16 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPOCK3Q9BQ16 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPOCK3Q9BQ16 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPOCK3Q9BQ16 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPOCK3Q9BQ16 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPOCK3Q9BQ16 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCK3Q9BQ16 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCK3Q9BQ16 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCK3Q9BQ16 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPOCK3Q9BQ16 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPOCK3Q9BQ16 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOCK3Q9BQ16 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOCK3Q9BQ16 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOCK3Q9BQ16 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOCK3Q9BQ16 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOCK3Q9BQ16 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCK3Q9BQ16 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCK3Q9BQ16 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCK3Q9BQ16 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOCK3Q9BQ16 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOCK3Q9BQ16 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOCK3Q9BQ16 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOCK3Q9BQ16 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOCK3Q9BQ16 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOCK3Q9BQ16 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOCK3Q9BQ16 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOCK3Q9BQ16 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOCK3Q9BQ16 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOCK3Q9BQ16 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOCK3Q9BQ16 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCK3Q9BQ16 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCK3Q9BQ16 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCK3Q9BQ16 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOCK3Q9BQ16 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOCK3Q9BQ16 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCK3Q9BQ16 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCK3Q9BQ16 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCK3Q9BQ16 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCK3Q9BQ16 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOCK3Q9BQ16 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOCK3Q9BQ16 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOCK3Q9BQ16 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPOCK3Q9BQ16 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms