Protein–RNA interactions for Protein: Q99519

NEU1, Sialidase-1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU1Q99519 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEU1Q99519 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEU1Q99519 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEU1Q99519 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEU1Q99519 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEU1Q99519 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEU1Q99519 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEU1Q99519 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEU1Q99519 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEU1Q99519 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU1Q99519 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU1Q99519 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU1Q99519 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEU1Q99519 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEU1Q99519 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU1Q99519 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU1Q99519 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU1Q99519 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NEU1Q99519 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEU1Q99519 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEU1Q99519 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEU1Q99519 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEU1Q99519 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEU1Q99519 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEU1Q99519 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEU1Q99519 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEU1Q99519 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEU1Q99519 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEU1Q99519 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEU1Q99519 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEU1Q99519 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEU1Q99519 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEU1Q99519 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEU1Q99519 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEU1Q99519 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEU1Q99519 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEU1Q99519 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEU1Q99519 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEU1Q99519 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEU1Q99519 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEU1Q99519 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEU1Q99519 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEU1Q99519 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEU1Q99519 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEU1Q99519 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEU1Q99519 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEU1Q99519 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEU1Q99519 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEU1Q99519 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEU1Q99519 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEU1Q99519 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEU1Q99519 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEU1Q99519 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEU1Q99519 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEU1Q99519 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEU1Q99519 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEU1Q99519 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEU1Q99519 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEU1Q99519 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEU1Q99519 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEU1Q99519 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEU1Q99519 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEU1Q99519 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEU1Q99519 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEU1Q99519 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEU1Q99519 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEU1Q99519 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEU1Q99519 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEU1Q99519 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEU1Q99519 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEU1Q99519 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEU1Q99519 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEU1Q99519 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEU1Q99519 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEU1Q99519 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEU1Q99519 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEU1Q99519 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEU1Q99519 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEU1Q99519 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEU1Q99519 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NEU1Q99519 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEU1Q99519 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEU1Q99519 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEU1Q99519 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEU1Q99519 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEU1Q99519 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEU1Q99519 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEU1Q99519 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEU1Q99519 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEU1Q99519 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEU1Q99519 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEU1Q99519 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEU1Q99519 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEU1Q99519 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEU1Q99519 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEU1Q99519 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEU1Q99519 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEU1Q99519 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NEU1Q99519 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEU1Q99519 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms