Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UHRF1Q96T88 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UHRF1Q96T88 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UHRF1Q96T88 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UHRF1Q96T88 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UHRF1Q96T88 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
UHRF1Q96T88 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
UHRF1Q96T88 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UHRF1Q96T88 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UHRF1Q96T88 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UHRF1Q96T88 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UHRF1Q96T88 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UHRF1Q96T88 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UHRF1Q96T88 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
UHRF1Q96T88 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
UHRF1Q96T88 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UHRF1Q96T88 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UHRF1Q96T88 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UHRF1Q96T88 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UHRF1Q96T88 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UHRF1Q96T88 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UHRF1Q96T88 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UHRF1Q96T88 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UHRF1Q96T88 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UHRF1Q96T88 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
UHRF1Q96T88 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UHRF1Q96T88 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UHRF1Q96T88 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UHRF1Q96T88 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UHRF1Q96T88 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UHRF1Q96T88 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UHRF1Q96T88 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
UHRF1Q96T88 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UHRF1Q96T88 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UHRF1Q96T88 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
UHRF1Q96T88 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UHRF1Q96T88 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UHRF1Q96T88 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UHRF1Q96T88 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UHRF1Q96T88 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UHRF1Q96T88 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UHRF1Q96T88 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UHRF1Q96T88 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UHRF1Q96T88 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UHRF1Q96T88 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
UHRF1Q96T88 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UHRF1Q96T88 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
UHRF1Q96T88 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UHRF1Q96T88 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UHRF1Q96T88 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UHRF1Q96T88 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UHRF1Q96T88 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UHRF1Q96T88 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UHRF1Q96T88 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UHRF1Q96T88 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UHRF1Q96T88 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UHRF1Q96T88 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UHRF1Q96T88 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
UHRF1Q96T88 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UHRF1Q96T88 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UHRF1Q96T88 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
UHRF1Q96T88 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UHRF1Q96T88 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
UHRF1Q96T88 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UHRF1Q96T88 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UHRF1Q96T88 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UHRF1Q96T88 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UHRF1Q96T88 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UHRF1Q96T88 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
UHRF1Q96T88 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UHRF1Q96T88 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UHRF1Q96T88 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UHRF1Q96T88 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UHRF1Q96T88 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UHRF1Q96T88 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UHRF1Q96T88 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UHRF1Q96T88 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UHRF1Q96T88 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UHRF1Q96T88 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UHRF1Q96T88 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UHRF1Q96T88 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UHRF1Q96T88 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UHRF1Q96T88 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UHRF1Q96T88 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UHRF1Q96T88 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UHRF1Q96T88 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
UHRF1Q96T88 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UHRF1Q96T88 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UHRF1Q96T88 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UHRF1Q96T88 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UHRF1Q96T88 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UHRF1Q96T88 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UHRF1Q96T88 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UHRF1Q96T88 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UHRF1Q96T88 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UHRF1Q96T88 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UHRF1Q96T88 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UHRF1Q96T88 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UHRF1Q96T88 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
UHRF1Q96T88 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
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