Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY1Q96T51 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY1Q96T51 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUFY1Q96T51 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUFY1Q96T51 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUFY1Q96T51 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUFY1Q96T51 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY1Q96T51 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY1Q96T51 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RUFY1Q96T51 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RUFY1Q96T51 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RUFY1Q96T51 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUFY1Q96T51 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUFY1Q96T51 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUFY1Q96T51 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUFY1Q96T51 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY1Q96T51 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY1Q96T51 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY1Q96T51 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUFY1Q96T51 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUFY1Q96T51 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RUFY1Q96T51 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUFY1Q96T51 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY1Q96T51 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY1Q96T51 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY1Q96T51 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY1Q96T51 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUFY1Q96T51 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUFY1Q96T51 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUFY1Q96T51 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY1Q96T51 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY1Q96T51 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RUFY1Q96T51 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RUFY1Q96T51 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RUFY1Q96T51 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY1Q96T51 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUFY1Q96T51 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUFY1Q96T51 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUFY1Q96T51 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUFY1Q96T51 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUFY1Q96T51 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY1Q96T51 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RUFY1Q96T51 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUFY1Q96T51 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUFY1Q96T51 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUFY1Q96T51 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUFY1Q96T51 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUFY1Q96T51 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUFY1Q96T51 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY1Q96T51 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUFY1Q96T51 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUFY1Q96T51 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY1Q96T51 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY1Q96T51 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY1Q96T51 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY1Q96T51 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUFY1Q96T51 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUFY1Q96T51 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUFY1Q96T51 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY1Q96T51 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUFY1Q96T51 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUFY1Q96T51 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY1Q96T51 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY1Q96T51 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY1Q96T51 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUFY1Q96T51 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUFY1Q96T51 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUFY1Q96T51 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY1Q96T51 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY1Q96T51 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY1Q96T51 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY1Q96T51 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY1Q96T51 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY1Q96T51 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY1Q96T51 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY1Q96T51 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY1Q96T51 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RUFY1Q96T51 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RUFY1Q96T51 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RUFY1Q96T51 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY1Q96T51 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUFY1Q96T51 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUFY1Q96T51 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY1Q96T51 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY1Q96T51 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUFY1Q96T51 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY1Q96T51 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY1Q96T51 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY1Q96T51 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY1Q96T51 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY1Q96T51 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY1Q96T51 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY1Q96T51 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY1Q96T51 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
RUFY1Q96T51 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY1Q96T51 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY1Q96T51 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY1Q96T51 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY1Q96T51 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUFY1Q96T51 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms