Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CSRNP1Q96S65 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CSRNP1Q96S65 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CSRNP1Q96S65 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CSRNP1Q96S65 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CSRNP1Q96S65 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CSRNP1Q96S65 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CSRNP1Q96S65 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CSRNP1Q96S65 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CSRNP1Q96S65 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSRNP1Q96S65 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSRNP1Q96S65 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CSRNP1Q96S65 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CSRNP1Q96S65 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CSRNP1Q96S65 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CSRNP1Q96S65 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP1Q96S65 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP1Q96S65 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP1Q96S65 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSRNP1Q96S65 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP1Q96S65 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP1Q96S65 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP1Q96S65 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CSRNP1Q96S65 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CSRNP1Q96S65 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP1Q96S65 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP1Q96S65 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP1Q96S65 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP1Q96S65 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP1Q96S65 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CSRNP1Q96S65 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CSRNP1Q96S65 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CSRNP1Q96S65 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CSRNP1Q96S65 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP1Q96S65 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CSRNP1Q96S65 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CSRNP1Q96S65 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CSRNP1Q96S65 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CSRNP1Q96S65 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CSRNP1Q96S65 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CSRNP1Q96S65 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CSRNP1Q96S65 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CSRNP1Q96S65 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CSRNP1Q96S65 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CSRNP1Q96S65 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CSRNP1Q96S65 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CSRNP1Q96S65 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CSRNP1Q96S65 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CSRNP1Q96S65 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSRNP1Q96S65 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSRNP1Q96S65 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSRNP1Q96S65 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CSRNP1Q96S65 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CSRNP1Q96S65 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CSRNP1Q96S65 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CSRNP1Q96S65 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CSRNP1Q96S65 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CSRNP1Q96S65 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CSRNP1Q96S65 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CSRNP1Q96S65 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CSRNP1Q96S65 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CSRNP1Q96S65 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CSRNP1Q96S65 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CSRNP1Q96S65 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CSRNP1Q96S65 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CSRNP1Q96S65 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CSRNP1Q96S65 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CSRNP1Q96S65 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CSRNP1Q96S65 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CSRNP1Q96S65 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CSRNP1Q96S65 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CSRNP1Q96S65 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CSRNP1Q96S65 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CSRNP1Q96S65 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CSRNP1Q96S65 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CSRNP1Q96S65 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CSRNP1Q96S65 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CSRNP1Q96S65 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CSRNP1Q96S65 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CSRNP1Q96S65 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CSRNP1Q96S65 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CSRNP1Q96S65 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CSRNP1Q96S65 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
CSRNP1Q96S65 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CSRNP1Q96S65 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CSRNP1Q96S65 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CSRNP1Q96S65 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CSRNP1Q96S65 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CSRNP1Q96S65 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CSRNP1Q96S65 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CSRNP1Q96S65 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CSRNP1Q96S65 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CSRNP1Q96S65 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CSRNP1Q96S65 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CSRNP1Q96S65 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CSRNP1Q96S65 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CSRNP1Q96S65 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CSRNP1Q96S65 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CSRNP1Q96S65 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CSRNP1Q96S65 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms