Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGAP4Q96P64 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP4Q96P64 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP4Q96P64 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP4Q96P64 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP4Q96P64 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP4Q96P64 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP4Q96P64 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGAP4Q96P64 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGAP4Q96P64 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP4Q96P64 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP4Q96P64 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGAP4Q96P64 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGAP4Q96P64 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGAP4Q96P64 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGAP4Q96P64 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGAP4Q96P64 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP4Q96P64 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP4Q96P64 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26■■□□□ 1.75
AGAP4Q96P64 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP4Q96P64 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP4Q96P64 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP4Q96P64 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP4Q96P64 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP4Q96P64 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP4Q96P64 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP4Q96P64 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP4Q96P64 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGAP4Q96P64 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGAP4Q96P64 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP4Q96P64 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP4Q96P64 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP4Q96P64 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP4Q96P64 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP4Q96P64 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGAP4Q96P64 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGAP4Q96P64 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP4Q96P64 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP4Q96P64 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP4Q96P64 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP4Q96P64 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP4Q96P64 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP4Q96P64 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGAP4Q96P64 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGAP4Q96P64 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGAP4Q96P64 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGAP4Q96P64 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AGAP4Q96P64 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AGAP4Q96P64 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AGAP4Q96P64 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGAP4Q96P64 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
AGAP4Q96P64 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGAP4Q96P64 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGAP4Q96P64 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGAP4Q96P64 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AGAP4Q96P64 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGAP4Q96P64 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGAP4Q96P64 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGAP4Q96P64 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGAP4Q96P64 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGAP4Q96P64 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
AGAP4Q96P64 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGAP4Q96P64 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGAP4Q96P64 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGAP4Q96P64 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGAP4Q96P64 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGAP4Q96P64 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGAP4Q96P64 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGAP4Q96P64 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGAP4Q96P64 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP4Q96P64 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP4Q96P64 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGAP4Q96P64 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGAP4Q96P64 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
AGAP4Q96P64 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGAP4Q96P64 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGAP4Q96P64 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP4Q96P64 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP4Q96P64 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGAP4Q96P64 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP4Q96P64 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP4Q96P64 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AGAP4Q96P64 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP4Q96P64 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP4Q96P64 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP4Q96P64 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP4Q96P64 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP4Q96P64 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP4Q96P64 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms