Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFXN2Q96NB2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFXN2Q96NB2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFXN2Q96NB2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFXN2Q96NB2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFXN2Q96NB2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFXN2Q96NB2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFXN2Q96NB2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFXN2Q96NB2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SFXN2Q96NB2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFXN2Q96NB2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFXN2Q96NB2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFXN2Q96NB2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFXN2Q96NB2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFXN2Q96NB2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SFXN2Q96NB2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFXN2Q96NB2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFXN2Q96NB2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFXN2Q96NB2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFXN2Q96NB2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFXN2Q96NB2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SFXN2Q96NB2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFXN2Q96NB2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFXN2Q96NB2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFXN2Q96NB2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFXN2Q96NB2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFXN2Q96NB2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFXN2Q96NB2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFXN2Q96NB2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFXN2Q96NB2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFXN2Q96NB2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFXN2Q96NB2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFXN2Q96NB2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFXN2Q96NB2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFXN2Q96NB2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFXN2Q96NB2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFXN2Q96NB2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFXN2Q96NB2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SFXN2Q96NB2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFXN2Q96NB2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFXN2Q96NB2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFXN2Q96NB2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFXN2Q96NB2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFXN2Q96NB2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFXN2Q96NB2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFXN2Q96NB2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SFXN2Q96NB2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFXN2Q96NB2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFXN2Q96NB2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFXN2Q96NB2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFXN2Q96NB2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFXN2Q96NB2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFXN2Q96NB2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFXN2Q96NB2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SFXN2Q96NB2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFXN2Q96NB2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFXN2Q96NB2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFXN2Q96NB2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFXN2Q96NB2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFXN2Q96NB2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFXN2Q96NB2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFXN2Q96NB2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFXN2Q96NB2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFXN2Q96NB2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFXN2Q96NB2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFXN2Q96NB2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFXN2Q96NB2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFXN2Q96NB2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFXN2Q96NB2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFXN2Q96NB2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFXN2Q96NB2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFXN2Q96NB2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFXN2Q96NB2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFXN2Q96NB2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFXN2Q96NB2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFXN2Q96NB2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFXN2Q96NB2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFXN2Q96NB2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFXN2Q96NB2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFXN2Q96NB2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SFXN2Q96NB2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFXN2Q96NB2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFXN2Q96NB2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFXN2Q96NB2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFXN2Q96NB2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFXN2Q96NB2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFXN2Q96NB2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFXN2Q96NB2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms