Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00526Q96FQ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00526Q96FQ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00526Q96FQ7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00526Q96FQ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00526Q96FQ7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00526Q96FQ7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00526Q96FQ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00526Q96FQ7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00526Q96FQ7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00526Q96FQ7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00526Q96FQ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00526Q96FQ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00526Q96FQ7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00526Q96FQ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00526Q96FQ7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00526Q96FQ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00526Q96FQ7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00526Q96FQ7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00526Q96FQ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00526Q96FQ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00526Q96FQ7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00526Q96FQ7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00526Q96FQ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00526Q96FQ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00526Q96FQ7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00526Q96FQ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00526Q96FQ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00526Q96FQ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00526Q96FQ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00526Q96FQ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00526Q96FQ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms