Protein–RNA interactions for Protein: Q96CU9

FOXRED1, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXRED1Q96CU9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXRED1Q96CU9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXRED1Q96CU9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXRED1Q96CU9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXRED1Q96CU9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXRED1Q96CU9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXRED1Q96CU9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXRED1Q96CU9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXRED1Q96CU9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXRED1Q96CU9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXRED1Q96CU9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
FOXRED1Q96CU9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
FOXRED1Q96CU9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXRED1Q96CU9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXRED1Q96CU9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXRED1Q96CU9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXRED1Q96CU9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXRED1Q96CU9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXRED1Q96CU9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXRED1Q96CU9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXRED1Q96CU9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXRED1Q96CU9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXRED1Q96CU9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXRED1Q96CU9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXRED1Q96CU9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXRED1Q96CU9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXRED1Q96CU9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXRED1Q96CU9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXRED1Q96CU9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXRED1Q96CU9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXRED1Q96CU9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXRED1Q96CU9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXRED1Q96CU9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXRED1Q96CU9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXRED1Q96CU9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXRED1Q96CU9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXRED1Q96CU9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXRED1Q96CU9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXRED1Q96CU9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXRED1Q96CU9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXRED1Q96CU9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXRED1Q96CU9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXRED1Q96CU9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXRED1Q96CU9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXRED1Q96CU9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXRED1Q96CU9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXRED1Q96CU9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXRED1Q96CU9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXRED1Q96CU9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXRED1Q96CU9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXRED1Q96CU9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXRED1Q96CU9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXRED1Q96CU9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXRED1Q96CU9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXRED1Q96CU9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXRED1Q96CU9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXRED1Q96CU9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXRED1Q96CU9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXRED1Q96CU9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXRED1Q96CU9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXRED1Q96CU9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXRED1Q96CU9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXRED1Q96CU9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXRED1Q96CU9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXRED1Q96CU9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXRED1Q96CU9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXRED1Q96CU9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXRED1Q96CU9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXRED1Q96CU9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXRED1Q96CU9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXRED1Q96CU9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXRED1Q96CU9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXRED1Q96CU9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXRED1Q96CU9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXRED1Q96CU9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXRED1Q96CU9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXRED1Q96CU9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXRED1Q96CU9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXRED1Q96CU9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXRED1Q96CU9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXRED1Q96CU9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXRED1Q96CU9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXRED1Q96CU9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms