Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW9

TAMM41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAMM41Q96BW9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAMM41Q96BW9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAMM41Q96BW9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAMM41Q96BW9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TAMM41Q96BW9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAMM41Q96BW9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAMM41Q96BW9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAMM41Q96BW9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TAMM41Q96BW9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAMM41Q96BW9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAMM41Q96BW9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAMM41Q96BW9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAMM41Q96BW9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAMM41Q96BW9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TAMM41Q96BW9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAMM41Q96BW9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAMM41Q96BW9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAMM41Q96BW9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAMM41Q96BW9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAMM41Q96BW9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAMM41Q96BW9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAMM41Q96BW9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAMM41Q96BW9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAMM41Q96BW9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAMM41Q96BW9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAMM41Q96BW9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAMM41Q96BW9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TAMM41Q96BW9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAMM41Q96BW9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAMM41Q96BW9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAMM41Q96BW9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAMM41Q96BW9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAMM41Q96BW9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAMM41Q96BW9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAMM41Q96BW9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAMM41Q96BW9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAMM41Q96BW9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAMM41Q96BW9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TAMM41Q96BW9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAMM41Q96BW9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAMM41Q96BW9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAMM41Q96BW9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAMM41Q96BW9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAMM41Q96BW9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAMM41Q96BW9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAMM41Q96BW9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAMM41Q96BW9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAMM41Q96BW9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAMM41Q96BW9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAMM41Q96BW9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAMM41Q96BW9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAMM41Q96BW9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAMM41Q96BW9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAMM41Q96BW9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAMM41Q96BW9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAMM41Q96BW9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAMM41Q96BW9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAMM41Q96BW9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAMM41Q96BW9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAMM41Q96BW9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAMM41Q96BW9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAMM41Q96BW9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAMM41Q96BW9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAMM41Q96BW9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAMM41Q96BW9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAMM41Q96BW9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAMM41Q96BW9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAMM41Q96BW9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAMM41Q96BW9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAMM41Q96BW9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAMM41Q96BW9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAMM41Q96BW9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TAMM41Q96BW9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAMM41Q96BW9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAMM41Q96BW9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAMM41Q96BW9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAMM41Q96BW9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAMM41Q96BW9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAMM41Q96BW9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAMM41Q96BW9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAMM41Q96BW9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAMM41Q96BW9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAMM41Q96BW9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAMM41Q96BW9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAMM41Q96BW9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms