Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFT1Q96AA3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFT1Q96AA3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFT1Q96AA3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFT1Q96AA3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFT1Q96AA3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFT1Q96AA3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFT1Q96AA3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFT1Q96AA3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFT1Q96AA3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFT1Q96AA3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFT1Q96AA3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFT1Q96AA3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFT1Q96AA3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFT1Q96AA3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFT1Q96AA3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFT1Q96AA3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFT1Q96AA3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFT1Q96AA3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFT1Q96AA3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFT1Q96AA3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFT1Q96AA3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFT1Q96AA3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFT1Q96AA3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFT1Q96AA3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFT1Q96AA3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFT1Q96AA3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFT1Q96AA3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
RFT1Q96AA3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFT1Q96AA3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFT1Q96AA3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RFT1Q96AA3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFT1Q96AA3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFT1Q96AA3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFT1Q96AA3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFT1Q96AA3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFT1Q96AA3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFT1Q96AA3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RFT1Q96AA3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFT1Q96AA3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFT1Q96AA3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFT1Q96AA3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFT1Q96AA3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFT1Q96AA3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFT1Q96AA3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFT1Q96AA3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFT1Q96AA3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFT1Q96AA3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFT1Q96AA3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFT1Q96AA3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFT1Q96AA3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFT1Q96AA3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFT1Q96AA3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFT1Q96AA3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFT1Q96AA3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFT1Q96AA3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFT1Q96AA3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFT1Q96AA3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFT1Q96AA3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFT1Q96AA3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFT1Q96AA3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFT1Q96AA3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFT1Q96AA3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFT1Q96AA3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFT1Q96AA3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFT1Q96AA3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFT1Q96AA3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFT1Q96AA3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFT1Q96AA3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFT1Q96AA3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFT1Q96AA3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFT1Q96AA3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFT1Q96AA3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFT1Q96AA3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFT1Q96AA3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFT1Q96AA3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFT1Q96AA3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFT1Q96AA3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RFT1Q96AA3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFT1Q96AA3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFT1Q96AA3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFT1Q96AA3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms