Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 NDRG2-257ENST00000556688 583 ntTSL 513.53□□□□□ -0.242e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-265ENST00000557182 559 ntTSL 413.38□□□□□ -0.272e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-231ENST00000554415 554 ntTSL 413.25□□□□□ -0.292e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-232ENST00000554419 583 ntTSL 313.25□□□□□ -0.292e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-259ENST00000556924 603 ntTSL 413.21□□□□□ -0.292e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-260ENST00000556974 1012 ntTSL 513.17□□□□□ -0.32e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-256ENST00000556561 580 ntTSL 513.04□□□□□ -0.322e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-223ENST00000553867 848 ntTSL 513.02□□□□□ -0.332e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.552e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-214ENST00000553442 639 ntTSL 511.26□□□□□ -0.612e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-210ENST00000397856 1309 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.632e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-248ENST00000555767 560 ntTSL 410.91□□□□□ -0.662e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-240ENST00000555026 1162 ntTSL 510.75□□□□□ -0.692e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-212ENST00000403829 1500 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.782e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-249ENST00000555869 871 ntTSL 510.06□□□□□ -0.82e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-250ENST00000556008 1051 ntTSL 59.77□□□□□ -0.852e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-255ENST00000556457 635 ntTSL 59.52□□□□□ -0.892e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-234ENST00000554483 561 ntTSL 48.8□□□□□ -12e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-224ENST00000553900 576 ntTSL 28.32□□□□□ -1.082e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-275ENST00000557669 657 ntTSL 28.32□□□□□ -1.082e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-229ENST00000554379 553 ntTSL 47.23□□□□□ -1.252e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 UBASH3B-201ENST00000284273 6912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.369e-9■■■■■ 129
TBRG4Q969Z0 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.673e-10■■■■■ 128.1
TBRG4Q969Z0 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.353e-10■■■■■ 128.1
TBRG4Q969Z0 TNKS-203ENST00000517770 574 ntTSL 45.31□□□□□ -1.563e-10■■■■■ 128.1
TBRG4Q969Z0 PRKAR1B-202ENST00000400758 888 ntTSL 324.88■■□□□ 1.571e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 SRM-205ENST00000487300 611 ntTSL 221.73■■□□□ 1.071e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 SSUH2-205ENST00000420394 1634 ntTSL 1 (best)20.37■□□□□ 0.851e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 SRM-202ENST00000459997 731 ntTSL 520.32■□□□□ 0.841e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.721e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 SSUH2-204ENST00000415132 1645 ntTSL 519.33■□□□□ 0.691e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.521e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 COA1-212ENST00000448704 1599 ntTSL 1 (best)17.93■□□□□ 0.461e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 SARDH-206ENST00000427237 1957 ntTSL 217.75■□□□□ 0.431e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 FRS2-202ENST00000547219 611 ntTSL 516.61■□□□□ 0.251e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 FRS2-207ENST00000550169 570 ntTSL 316.61■□□□□ 0.251e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.241e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CSGALNACT1-216ENST00000524213 554 ntTSL 216.4■□□□□ 0.227e-8■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CSGALNACT1-213ENST00000523262 792 ntTSL 215.38■□□□□ 0.057e-8■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.041e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CSGALNACT1-204ENST00000517494 766 ntTSL 314.71□□□□□ -0.057e-8■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.121e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 FRS2-204ENST00000548154 597 ntTSL 214.05□□□□□ -0.161e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 PRKAB1-203ENST00000537400 555 ntTSL 314.01□□□□□ -0.171e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.171e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.231e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 FRS2-210ENST00000550937 781 ntTSL 513.56□□□□□ -0.241e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 FRS2-203ENST00000547414 521 ntTSL 513.56□□□□□ -0.241e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 FRS2-208ENST00000550316 545 ntTSL 513.34□□□□□ -0.271e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 FRS2-205ENST00000549092 584 ntTSL 413.18□□□□□ -0.31e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.31e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.311e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 SSUH2-207ENST00000435138 2632 ntTSL 212.81□□□□□ -0.361e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CSF3R-206ENST00000464365 1659 ntTSL 512.78□□□□□ -0.361e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.371e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.381e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.391e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CSF3R-210ENST00000480825 6074 ntTSL 212.58□□□□□ -0.391e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.411e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 SRM-203ENST00000465788 402 ntTSL 512.46□□□□□ -0.411e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 COA1-206ENST00000418140 1372 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.441e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 GRIPAP1-201ENST00000376423 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.471e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 SSUH2-201ENST00000317371 2561 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.51e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CSF3R-202ENST00000361632 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.521e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 GRIPAP1-203ENST00000474512 904 ntTSL 211.7□□□□□ -0.541e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CSF3R-209ENST00000469380 321 ntTSL 211.65□□□□□ -0.541e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 STK38-201ENST00000229812 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 GRIPAP1-202ENST00000473581 3278 ntTSL 211.27□□□□□ -0.611e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 SSUH2-208ENST00000455157 3219 ntTSL 211.26□□□□□ -0.611e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.641e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 SSUH2-210ENST00000466215 492 ntTSL 310.85□□□□□ -0.671e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 COA1-208ENST00000431651 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 310.73□□□□□ -0.691e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CSF3R-205ENST00000373106 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.731e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 COA1-214ENST00000457939 406 ntTSL 310.48□□□□□ -0.731e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 DCAF12-201ENST00000361264 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.731e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 COA1-213ENST00000451651 585 ntTSL 310.46□□□□□ -0.731e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 COA1-217ENST00000478504 552 ntTSL 410.36□□□□□ -0.751e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 DCAF12-202ENST00000396990 803 ntTSL 310.26□□□□□ -0.771e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.781e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 GRIPAP1-209ENST00000611757 3255 ntTSL 29.85□□□□□ -0.831e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 COA1-205ENST00000415798 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 49.55□□□□□ -0.881e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CSF3R-203ENST00000373103 3454 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.961e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 COA1-209ENST00000438444 3223 ntTSL 28.7□□□□□ -1.021e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 DCAF12-204ENST00000463286 682 ntTSL 38.69□□□□□ -1.021e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 DCAF12-203ENST00000450964 676 ntTSL 58.64□□□□□ -1.031e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 COA1-204ENST00000415076 1737 ntTSL 38.3□□□□□ -1.081e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 COA1-210ENST00000446330 1520 ntTSL 27.83□□□□□ -1.161e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 COA1-211ENST00000446564 1177 ntTSL 27.74□□□□□ -1.171e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.361e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 COA1-216ENST00000470156 569 ntTSL 1 (best)5.97□□□□□ -1.451e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CCDC88A-203ENST00000412148 2880 ntTSL 1 (best)5.81□□□□□ -1.481e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 COA1-207ENST00000420441 547 ntTSL 25.09□□□□□ -1.591e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.641e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 CCDC88A-208ENST00000444458 4236 ntTSL 22.08□□□□□ -2.081e-14■■■■■ 125.5
TBRG4Q969Z0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.552e-6■■■■■ 124.2
TBRG4Q969Z0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.781e-15■■■■■ 123.8
TBRG4Q969Z0 LEF1-212ENST00000506680 1280 ntTSL 1 (best)19.54■□□□□ 0.721e-15■■■■■ 123.8
TBRG4Q969Z0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.441e-15■■■■■ 123.8
TBRG4Q969Z0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.011e-15■■■■■ 123.8
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 317.5 ms