Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.414e-74■■■■■ 396.8
TBRG4Q969Z0 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.61e-323■■■■■ 373.5
TBRG4Q969Z0 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.73□□□□□ -0.218e-43■■■■■ 229.3
TBRG4Q969Z0 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.07□□□□□ -0.648e-43■■■■■ 229.3
TBRG4Q969Z0 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt11.05□□□□□ -0.648e-43■■■■■ 229.3
TBRG4Q969Z0 ATP5A1-205ENST00000586592 2214 ntTSL 223.31■■□□□ 1.325e-23■■■■■ 196.1
TBRG4Q969Z0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.265e-23■■■■■ 196.1
TBRG4Q969Z0 EHMT1-214ENST00000488242 789 ntTSL 514.25□□□□□ -0.135e-23■■■■■ 196.1
TBRG4Q969Z0 ATP5A1-211ENST00000590156 1931 ntTSL 214.16□□□□□ -0.145e-23■■■■■ 196.1
TBRG4Q969Z0 EHMT1-213ENST00000486164 781 ntTSL 313.72□□□□□ -0.215e-23■■■■■ 196.1
TBRG4Q969Z0 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.35e-23■■■■■ 196.1
TBRG4Q969Z0 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.335e-23■■■■■ 196.1
TBRG4Q969Z0 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 511.75□□□□□ -0.535e-23■■■■■ 196.1
TBRG4Q969Z0 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.695e-23■■■■■ 196.1
TBRG4Q969Z0 ATP5A1-206ENST00000587902 571 ntTSL 29.39□□□□□ -0.915e-23■■■■■ 196.1
TBRG4Q969Z0 EHMT1-249ENST00000637949 575 ntTSL 58.6□□□□□ -1.035e-23■■■■■ 196.1
TBRG4Q969Z0 ATP5A1-204ENST00000586523 4547 nt6.74□□□□□ -1.335e-23■■■■■ 196.1
TBRG4Q969Z0 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.39□□□□□ -1.871e-14■■■■■ 182.5
TBRG4Q969Z0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.094e-21■■■■■ 180.5
TBRG4Q969Z0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.154e-21■■■■■ 180.5
TBRG4Q969Z0 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.184e-21■■■■■ 180.5
TBRG4Q969Z0 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.244e-21■■■■■ 180.5
TBRG4Q969Z0 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.244e-21■■■■■ 180.5
TBRG4Q969Z0 NUDT1-208ENST00000471348 263 ntTSL 313.45□□□□□ -0.264e-21■■■■■ 180.5
TBRG4Q969Z0 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.264e-21■■■■■ 180.5
TBRG4Q969Z0 DUSP3-202ENST00000590342 2077 ntTSL 1 (best)13.83□□□□□ -0.23e-20■■■■■ 172.6
TBRG4Q969Z0 CTIF-204ENST00000587769 547 ntTSL 410.77□□□□□ -0.693e-20■■■■■ 172.6
TBRG4Q969Z0 DUSP3-201ENST00000226004 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.93e-20■■■■■ 172.6
TBRG4Q969Z0 DUSP3-204ENST00000590935 3666 ntTSL 58.61□□□□□ -1.033e-20■■■■■ 172.6
TBRG4Q969Z0 DUSP3-203ENST00000590753 1019 ntTSL 58.46□□□□□ -1.063e-20■■■■■ 172.6
TBRG4Q969Z0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.97e-21■■■■■ 165.1
TBRG4Q969Z0 SPN-205ENST00000563039 1853 ntTSL 519.16■□□□□ 0.667e-21■■■■■ 165.1
TBRG4Q969Z0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.187e-21■■■■■ 165.1
TBRG4Q969Z0 HELZ-210ENST00000581159 617 ntTSL 315.72■□□□□ 0.113e-19■■■■■ 164.8
TBRG4Q969Z0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.133e-19■■■■■ 164.8
TBRG4Q969Z0 KRBA1-208ENST00000497895 527 ntTSL 318.61■□□□□ 0.579e-19■■■■■ 162.1
TBRG4Q969Z0 KRBA1-201ENST00000319551 4020 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.379e-19■■■■■ 162.1
TBRG4Q969Z0 KRBA1-209ENST00000621069 3449 ntTSL 1 (best)12.43□□□□□ -0.429e-19■■■■■ 162.1
TBRG4Q969Z0 KRBA1-203ENST00000485033 3434 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.549e-19■■■■■ 162.1
TBRG4Q969Z0 KRBA1-207ENST00000496259 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.639e-19■■■■■ 162.1
TBRG4Q969Z0 UBASH3B-207ENST00000530917 987 ntTSL 511.96□□□□□ -0.495e-20■■■■■ 158.2
TBRG4Q969Z0 UBASH3B-208ENST00000533451 1032 ntTSL 211.3□□□□□ -0.65e-20■■■■■ 158.2
TBRG4Q969Z0 UBASH3B-205ENST00000529998 698 ntTSL 48.52□□□□□ -1.055e-20■■■■■ 158.2
TBRG4Q969Z0 KRBA1-204ENST00000486744 596 ntTSL 323.59■■□□□ 1.372e-18■■■■■ 156.9
TBRG4Q969Z0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.122e-18■■■■■ 156.9
TBRG4Q969Z0 AL669831.3-205ENST00000641296 1127 nt17.16■□□□□ 0.342e-18■■■■■ 156.9
TBRG4Q969Z0 AL669831.3-204ENST00000440196 1022 ntTSL 517.07■□□□□ 0.322e-18■■■■■ 156.9
TBRG4Q969Z0 AL669831.3-210ENST00000452176 818 ntTSL 1 (best)9.2□□□□□ -0.942e-18■■■■■ 156.9
TBRG4Q969Z0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.772e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 TSPAN14-204ENST00000372157 855 ntTSL 519.53■□□□□ 0.722e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.722e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.66e-7■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 ARHGEF1-221ENST00000600387 2272 ntTSL 318.74■□□□□ 0.592e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.582e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.532e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 EHMT1-248ENST00000637891 1930 ntTSL 516.49■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 02e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 ARHGEF1-214ENST00000596957 570 ntTSL 314.88□□□□□ -0.032e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 TTC7A-205ENST00000440051 641 ntTSL 514.72□□□□□ -0.052e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 BCAR3-203ENST00000370244 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.452e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 EHMT1-205ENST00000462942 7842 ntTSL 211.28□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 BCAR3-206ENST00000469315 490 ntTSL 210.87□□□□□ -0.672e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 TSPAN14-206ENST00000372164 5476 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.752e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 510.16□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 LINC01376-203ENST00000432142 571 ntTSL 49.03□□□□□ -0.962e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 LINC01376-201ENST00000418165 553 ntTSL 48.02□□□□□ -1.132e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.342e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.692e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 TMEM2-212ENST00000545719 533 ntTSL 44.41□□□□□ -1.72e-17■■■■■ 149.1
TBRG4Q969Z0 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.17□□□□□ -2.441e-323■■■■■ 148.6
TBRG4Q969Z0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.333e-22■■■■■ 147.1
TBRG4Q969Z0 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.053e-22■■■■■ 147.1
TBRG4Q969Z0 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.053e-22■■■■■ 147.1
TBRG4Q969Z0 PTPRK-213ENST00000490332 612 ntTSL 55□□□□□ -1.613e-18■■■■■ 144.4
TBRG4Q969Z0 PTPRK-202ENST00000368205 662 ntTSL 23.14□□□□□ -1.913e-18■■■■■ 144.4
TBRG4Q969Z0 PTPRK-215ENST00000498284 524 ntTSL 52.94□□□□□ -1.943e-18■■■■■ 144.4
TBRG4Q969Z0 GCN1-207ENST00000550471 918 ntTSL 319.49■□□□□ 0.712e-16■■■■■ 141.2
TBRG4Q969Z0 TBKBP1-203ENST00000578982 733 ntTSL 318.42■□□□□ 0.542e-16■■■■■ 141.2
TBRG4Q969Z0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.512e-16■■■■■ 141.2
TBRG4Q969Z0 EVL-213ENST00000554695 1119 ntTSL 516.79■□□□□ 0.282e-16■■■■■ 141.2
TBRG4Q969Z0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-16■■■■■ 141.2
TBRG4Q969Z0 MPRIP-209ENST00000466186 880 ntTSL 516.26■□□□□ 0.192e-16■■■■■ 141.2
TBRG4Q969Z0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-16■■■■■ 141.2
TBRG4Q969Z0 MPRIP-219ENST00000584067 3195 ntTSL 1 (best)14.66□□□□□ -0.062e-16■■■■■ 141.2
TBRG4Q969Z0 QSOX1-204ENST00000443059 893 ntTSL 214.27□□□□□ -0.132e-16■■■■■ 141.2
TBRG4Q969Z0 EVL-209ENST00000554031 819 ntTSL 514.15□□□□□ -0.142e-16■■■■■ 141.2
TBRG4Q969Z0 INTS6-AS1-229ENST00000629988 488 ntTSL 54.74□□□□□ -1.652e-16■■■■■ 141.2
TBRG4Q969Z0 INTS6-AS1-228ENST00000626895 527 ntTSL 52.6□□□□□ -1.992e-16■■■■■ 141.2
TBRG4Q969Z0 ETV6-202ENST00000396373 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.574e-15■■■■■ 139
TBRG4Q969Z0 FBXO41-203ENST00000520186 817 ntTSL 322.83■■□□□ 1.251e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 ACTB-203ENST00000417101 472 ntTSL 421.07■□□□□ 0.961e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.881e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 ACTB-211ENST00000480301 657 ntTSL 1 (best)20.52■□□□□ 0.881e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 C7orf50-204ENST00000412051 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.51■□□□□ 0.871e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 ACTB-210ENST00000477812 820 ntTSL 219.71■□□□□ 0.751e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 ACTB-212ENST00000484841 1032 ntTSL 519.59■□□□□ 0.731e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.721e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.641e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.591e-15■■■■■ 133.4
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 63 ms