Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NXPE3Q969Y0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NXPE3Q969Y0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NXPE3Q969Y0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NXPE3Q969Y0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NXPE3Q969Y0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NXPE3Q969Y0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NXPE3Q969Y0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NXPE3Q969Y0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NXPE3Q969Y0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NXPE3Q969Y0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NXPE3Q969Y0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NXPE3Q969Y0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NXPE3Q969Y0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NXPE3Q969Y0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NXPE3Q969Y0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NXPE3Q969Y0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NXPE3Q969Y0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NXPE3Q969Y0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NXPE3Q969Y0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NXPE3Q969Y0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NXPE3Q969Y0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NXPE3Q969Y0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NXPE3Q969Y0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NXPE3Q969Y0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NXPE3Q969Y0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NXPE3Q969Y0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NXPE3Q969Y0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NXPE3Q969Y0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NXPE3Q969Y0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NXPE3Q969Y0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NXPE3Q969Y0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NXPE3Q969Y0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NXPE3Q969Y0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NXPE3Q969Y0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NXPE3Q969Y0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NXPE3Q969Y0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NXPE3Q969Y0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NXPE3Q969Y0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NXPE3Q969Y0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NXPE3Q969Y0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NXPE3Q969Y0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NXPE3Q969Y0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NXPE3Q969Y0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NXPE3Q969Y0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NXPE3Q969Y0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NXPE3Q969Y0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NXPE3Q969Y0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NXPE3Q969Y0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NXPE3Q969Y0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NXPE3Q969Y0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NXPE3Q969Y0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NXPE3Q969Y0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NXPE3Q969Y0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NXPE3Q969Y0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NXPE3Q969Y0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NXPE3Q969Y0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NXPE3Q969Y0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NXPE3Q969Y0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NXPE3Q969Y0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NXPE3Q969Y0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NXPE3Q969Y0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NXPE3Q969Y0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NXPE3Q969Y0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NXPE3Q969Y0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NXPE3Q969Y0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NXPE3Q969Y0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NXPE3Q969Y0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NXPE3Q969Y0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NXPE3Q969Y0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NXPE3Q969Y0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NXPE3Q969Y0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NXPE3Q969Y0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NXPE3Q969Y0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NXPE3Q969Y0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NXPE3Q969Y0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NXPE3Q969Y0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NXPE3Q969Y0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NXPE3Q969Y0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NXPE3Q969Y0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NXPE3Q969Y0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NXPE3Q969Y0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NXPE3Q969Y0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NXPE3Q969Y0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NXPE3Q969Y0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NXPE3Q969Y0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NXPE3Q969Y0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NXPE3Q969Y0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NXPE3Q969Y0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NXPE3Q969Y0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NXPE3Q969Y0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NXPE3Q969Y0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NXPE3Q969Y0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NXPE3Q969Y0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NXPE3Q969Y0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NXPE3Q969Y0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NXPE3Q969Y0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NXPE3Q969Y0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NXPE3Q969Y0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NXPE3Q969Y0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms