Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR4A3Q92570 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR4A3Q92570 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR4A3Q92570 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR4A3Q92570 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR4A3Q92570 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR4A3Q92570 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR4A3Q92570 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR4A3Q92570 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR4A3Q92570 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR4A3Q92570 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NR4A3Q92570 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR4A3Q92570 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR4A3Q92570 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR4A3Q92570 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR4A3Q92570 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR4A3Q92570 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR4A3Q92570 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR4A3Q92570 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NR4A3Q92570 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR4A3Q92570 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NR4A3Q92570 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR4A3Q92570 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR4A3Q92570 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR4A3Q92570 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR4A3Q92570 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR4A3Q92570 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR4A3Q92570 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR4A3Q92570 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR4A3Q92570 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NR4A3Q92570 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR4A3Q92570 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR4A3Q92570 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NR4A3Q92570 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR4A3Q92570 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR4A3Q92570 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR4A3Q92570 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR4A3Q92570 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR4A3Q92570 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR4A3Q92570 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR4A3Q92570 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR4A3Q92570 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR4A3Q92570 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR4A3Q92570 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR4A3Q92570 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NR4A3Q92570 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR4A3Q92570 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR4A3Q92570 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR4A3Q92570 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR4A3Q92570 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR4A3Q92570 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR4A3Q92570 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR4A3Q92570 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR4A3Q92570 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NR4A3Q92570 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR4A3Q92570 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR4A3Q92570 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR4A3Q92570 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR4A3Q92570 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR4A3Q92570 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR4A3Q92570 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR4A3Q92570 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR4A3Q92570 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR4A3Q92570 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR4A3Q92570 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR4A3Q92570 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR4A3Q92570 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR4A3Q92570 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR4A3Q92570 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR4A3Q92570 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR4A3Q92570 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR4A3Q92570 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR4A3Q92570 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR4A3Q92570 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR4A3Q92570 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR4A3Q92570 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR4A3Q92570 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR4A3Q92570 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR4A3Q92570 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR4A3Q92570 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR4A3Q92570 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR4A3Q92570 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR4A3Q92570 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR4A3Q92570 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR4A3Q92570 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NR4A3Q92570 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR4A3Q92570 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR4A3Q92570 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NR4A3Q92570 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR4A3Q92570 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR4A3Q92570 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR4A3Q92570 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR4A3Q92570 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR4A3Q92570 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR4A3Q92570 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR4A3Q92570 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR4A3Q92570 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR4A3Q92570 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR4A3Q92570 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR4A3Q92570 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms