Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAB3Q8WWW8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GAB3Q8WWW8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GAB3Q8WWW8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GAB3Q8WWW8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GAB3Q8WWW8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GAB3Q8WWW8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAB3Q8WWW8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAB3Q8WWW8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAB3Q8WWW8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAB3Q8WWW8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAB3Q8WWW8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAB3Q8WWW8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAB3Q8WWW8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAB3Q8WWW8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GAB3Q8WWW8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAB3Q8WWW8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GAB3Q8WWW8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GAB3Q8WWW8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GAB3Q8WWW8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GAB3Q8WWW8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GAB3Q8WWW8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GAB3Q8WWW8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GAB3Q8WWW8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GAB3Q8WWW8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GAB3Q8WWW8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAB3Q8WWW8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GAB3Q8WWW8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAB3Q8WWW8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAB3Q8WWW8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GAB3Q8WWW8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAB3Q8WWW8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAB3Q8WWW8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAB3Q8WWW8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GAB3Q8WWW8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GAB3Q8WWW8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAB3Q8WWW8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GAB3Q8WWW8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GAB3Q8WWW8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAB3Q8WWW8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GAB3Q8WWW8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GAB3Q8WWW8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GAB3Q8WWW8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAB3Q8WWW8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GAB3Q8WWW8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GAB3Q8WWW8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GAB3Q8WWW8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAB3Q8WWW8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAB3Q8WWW8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAB3Q8WWW8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAB3Q8WWW8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAB3Q8WWW8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GAB3Q8WWW8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAB3Q8WWW8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAB3Q8WWW8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GAB3Q8WWW8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GAB3Q8WWW8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAB3Q8WWW8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAB3Q8WWW8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAB3Q8WWW8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GAB3Q8WWW8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GAB3Q8WWW8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GAB3Q8WWW8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GAB3Q8WWW8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GAB3Q8WWW8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAB3Q8WWW8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GAB3Q8WWW8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GAB3Q8WWW8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAB3Q8WWW8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAB3Q8WWW8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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GAB3Q8WWW8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GAB3Q8WWW8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
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GAB3Q8WWW8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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GAB3Q8WWW8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAB3Q8WWW8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAB3Q8WWW8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAB3Q8WWW8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAB3Q8WWW8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAB3Q8WWW8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAB3Q8WWW8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAB3Q8WWW8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAB3Q8WWW8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAB3Q8WWW8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAB3Q8WWW8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAB3Q8WWW8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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GAB3Q8WWW8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAB3Q8WWW8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GAB3Q8WWW8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GAB3Q8WWW8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAB3Q8WWW8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAB3Q8WWW8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GAB3Q8WWW8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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