Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFQ6

BPIFC, BPI fold-containing family C protein, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFCQ8NFQ6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFCQ8NFQ6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFCQ8NFQ6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFCQ8NFQ6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFCQ8NFQ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFCQ8NFQ6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFCQ8NFQ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFCQ8NFQ6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFCQ8NFQ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFCQ8NFQ6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFCQ8NFQ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFCQ8NFQ6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFCQ8NFQ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFCQ8NFQ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFCQ8NFQ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFCQ8NFQ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFCQ8NFQ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFCQ8NFQ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFCQ8NFQ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFCQ8NFQ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFCQ8NFQ6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFCQ8NFQ6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFCQ8NFQ6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFCQ8NFQ6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFCQ8NFQ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFCQ8NFQ6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFCQ8NFQ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFCQ8NFQ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFCQ8NFQ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFCQ8NFQ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFCQ8NFQ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFCQ8NFQ6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFCQ8NFQ6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFCQ8NFQ6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFCQ8NFQ6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFCQ8NFQ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFCQ8NFQ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFCQ8NFQ6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFCQ8NFQ6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFCQ8NFQ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFCQ8NFQ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFCQ8NFQ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFCQ8NFQ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFCQ8NFQ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFCQ8NFQ6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFCQ8NFQ6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFCQ8NFQ6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFCQ8NFQ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFCQ8NFQ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFCQ8NFQ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFCQ8NFQ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFCQ8NFQ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFCQ8NFQ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFCQ8NFQ6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFCQ8NFQ6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFCQ8NFQ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFCQ8NFQ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFCQ8NFQ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPIFCQ8NFQ6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPIFCQ8NFQ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFCQ8NFQ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFCQ8NFQ6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFCQ8NFQ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFCQ8NFQ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms