Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
LTBP4Q8N2S1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
LTBP4Q8N2S1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.17
LTBP4Q8N2S1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
LTBP4Q8N2S1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
LTBP4Q8N2S1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
LTBP4Q8N2S1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
LTBP4Q8N2S1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
LTBP4Q8N2S1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
LTBP4Q8N2S1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.01■■■■■ 4.16
LTBP4Q8N2S1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
LTBP4Q8N2S1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
LTBP4Q8N2S1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
LTBP4Q8N2S1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
LTBP4Q8N2S1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
LTBP4Q8N2S1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
LTBP4Q8N2S1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
LTBP4Q8N2S1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
LTBP4Q8N2S1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
LTBP4Q8N2S1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
LTBP4Q8N2S1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
LTBP4Q8N2S1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
LTBP4Q8N2S1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
LTBP4Q8N2S1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
LTBP4Q8N2S1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
LTBP4Q8N2S1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
LTBP4Q8N2S1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
LTBP4Q8N2S1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
LTBP4Q8N2S1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
LTBP4Q8N2S1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
LTBP4Q8N2S1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
LTBP4Q8N2S1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
LTBP4Q8N2S1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
LTBP4Q8N2S1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
LTBP4Q8N2S1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
LTBP4Q8N2S1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
LTBP4Q8N2S1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
LTBP4Q8N2S1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
LTBP4Q8N2S1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
LTBP4Q8N2S1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
LTBP4Q8N2S1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.57■■■■■ 4.09
LTBP4Q8N2S1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
LTBP4Q8N2S1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
LTBP4Q8N2S1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
LTBP4Q8N2S1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
LTBP4Q8N2S1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
LTBP4Q8N2S1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
LTBP4Q8N2S1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
LTBP4Q8N2S1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
LTBP4Q8N2S1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
LTBP4Q8N2S1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
LTBP4Q8N2S1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
LTBP4Q8N2S1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
LTBP4Q8N2S1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
LTBP4Q8N2S1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
LTBP4Q8N2S1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
LTBP4Q8N2S1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
LTBP4Q8N2S1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
LTBP4Q8N2S1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
LTBP4Q8N2S1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
LTBP4Q8N2S1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
LTBP4Q8N2S1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
LTBP4Q8N2S1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
LTBP4Q8N2S1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
LTBP4Q8N2S1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
LTBP4Q8N2S1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
LTBP4Q8N2S1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
LTBP4Q8N2S1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
LTBP4Q8N2S1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
LTBP4Q8N2S1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
LTBP4Q8N2S1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
LTBP4Q8N2S1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
LTBP4Q8N2S1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
LTBP4Q8N2S1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
LTBP4Q8N2S1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
LTBP4Q8N2S1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
LTBP4Q8N2S1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
LTBP4Q8N2S1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
LTBP4Q8N2S1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
LTBP4Q8N2S1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.13■■■■■ 4.02
LTBP4Q8N2S1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
LTBP4Q8N2S1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
LTBP4Q8N2S1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
LTBP4Q8N2S1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.08■■■■■ 4.01
LTBP4Q8N2S1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
LTBP4Q8N2S1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
LTBP4Q8N2S1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
LTBP4Q8N2S1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
LTBP4Q8N2S1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
LTBP4Q8N2S1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
LTBP4Q8N2S1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
LTBP4Q8N2S1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
LTBP4Q8N2S1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
LTBP4Q8N2S1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
LTBP4Q8N2S1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
LTBP4Q8N2S1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
LTBP4Q8N2S1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
LTBP4Q8N2S1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
LTBP4Q8N2S1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
LTBP4Q8N2S1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms