Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUQ0

CLVS1, Clavesin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1Q8IUQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLVS1Q8IUQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLVS1Q8IUQ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLVS1Q8IUQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLVS1Q8IUQ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLVS1Q8IUQ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLVS1Q8IUQ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLVS1Q8IUQ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLVS1Q8IUQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLVS1Q8IUQ0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLVS1Q8IUQ0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLVS1Q8IUQ0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLVS1Q8IUQ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLVS1Q8IUQ0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLVS1Q8IUQ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLVS1Q8IUQ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLVS1Q8IUQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLVS1Q8IUQ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLVS1Q8IUQ0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLVS1Q8IUQ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLVS1Q8IUQ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLVS1Q8IUQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLVS1Q8IUQ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLVS1Q8IUQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLVS1Q8IUQ0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLVS1Q8IUQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLVS1Q8IUQ0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLVS1Q8IUQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLVS1Q8IUQ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLVS1Q8IUQ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLVS1Q8IUQ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLVS1Q8IUQ0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLVS1Q8IUQ0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLVS1Q8IUQ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLVS1Q8IUQ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLVS1Q8IUQ0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLVS1Q8IUQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLVS1Q8IUQ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLVS1Q8IUQ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLVS1Q8IUQ0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLVS1Q8IUQ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLVS1Q8IUQ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLVS1Q8IUQ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLVS1Q8IUQ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLVS1Q8IUQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLVS1Q8IUQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLVS1Q8IUQ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLVS1Q8IUQ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLVS1Q8IUQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLVS1Q8IUQ0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLVS1Q8IUQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLVS1Q8IUQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLVS1Q8IUQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLVS1Q8IUQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLVS1Q8IUQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLVS1Q8IUQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLVS1Q8IUQ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLVS1Q8IUQ0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLVS1Q8IUQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLVS1Q8IUQ0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLVS1Q8IUQ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLVS1Q8IUQ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLVS1Q8IUQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLVS1Q8IUQ0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLVS1Q8IUQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLVS1Q8IUQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLVS1Q8IUQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLVS1Q8IUQ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLVS1Q8IUQ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLVS1Q8IUQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLVS1Q8IUQ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLVS1Q8IUQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLVS1Q8IUQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLVS1Q8IUQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLVS1Q8IUQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLVS1Q8IUQ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLVS1Q8IUQ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLVS1Q8IUQ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLVS1Q8IUQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLVS1Q8IUQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLVS1Q8IUQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLVS1Q8IUQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLVS1Q8IUQ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLVS1Q8IUQ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLVS1Q8IUQ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLVS1Q8IUQ0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLVS1Q8IUQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLVS1Q8IUQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLVS1Q8IUQ0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLVS1Q8IUQ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLVS1Q8IUQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLVS1Q8IUQ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLVS1Q8IUQ0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLVS1Q8IUQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLVS1Q8IUQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLVS1Q8IUQ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLVS1Q8IUQ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLVS1Q8IUQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLVS1Q8IUQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLVS1Q8IUQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms