Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUG1

KRTAP1-3, Keratin-associated protein 1-3, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-3Q8IUG1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRTAP1-3Q8IUG1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KRTAP1-3Q8IUG1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRTAP1-3Q8IUG1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRTAP1-3Q8IUG1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KRTAP1-3Q8IUG1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRTAP1-3Q8IUG1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRTAP1-3Q8IUG1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRTAP1-3Q8IUG1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KRTAP1-3Q8IUG1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRTAP1-3Q8IUG1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRTAP1-3Q8IUG1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRTAP1-3Q8IUG1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRTAP1-3Q8IUG1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRTAP1-3Q8IUG1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRTAP1-3Q8IUG1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRTAP1-3Q8IUG1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRTAP1-3Q8IUG1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRTAP1-3Q8IUG1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRTAP1-3Q8IUG1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRTAP1-3Q8IUG1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRTAP1-3Q8IUG1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRTAP1-3Q8IUG1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRTAP1-3Q8IUG1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRTAP1-3Q8IUG1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRTAP1-3Q8IUG1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRTAP1-3Q8IUG1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KRTAP1-3Q8IUG1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRTAP1-3Q8IUG1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRTAP1-3Q8IUG1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRTAP1-3Q8IUG1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRTAP1-3Q8IUG1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRTAP1-3Q8IUG1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRTAP1-3Q8IUG1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRTAP1-3Q8IUG1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRTAP1-3Q8IUG1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP1-3Q8IUG1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRTAP1-3Q8IUG1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRTAP1-3Q8IUG1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRTAP1-3Q8IUG1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRTAP1-3Q8IUG1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRTAP1-3Q8IUG1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRTAP1-3Q8IUG1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRTAP1-3Q8IUG1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRTAP1-3Q8IUG1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRTAP1-3Q8IUG1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRTAP1-3Q8IUG1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRTAP1-3Q8IUG1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRTAP1-3Q8IUG1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP1-3Q8IUG1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP1-3Q8IUG1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP1-3Q8IUG1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP1-3Q8IUG1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP1-3Q8IUG1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRTAP1-3Q8IUG1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRTAP1-3Q8IUG1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRTAP1-3Q8IUG1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRTAP1-3Q8IUG1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRTAP1-3Q8IUG1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRTAP1-3Q8IUG1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTAP1-3Q8IUG1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTAP1-3Q8IUG1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRTAP1-3Q8IUG1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTAP1-3Q8IUG1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTAP1-3Q8IUG1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTAP1-3Q8IUG1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTAP1-3Q8IUG1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRTAP1-3Q8IUG1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRTAP1-3Q8IUG1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRTAP1-3Q8IUG1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTAP1-3Q8IUG1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTAP1-3Q8IUG1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTAP1-3Q8IUG1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTAP1-3Q8IUG1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRTAP1-3Q8IUG1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRTAP1-3Q8IUG1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP1-3Q8IUG1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP1-3Q8IUG1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP1-3Q8IUG1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTAP1-3Q8IUG1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTAP1-3Q8IUG1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTAP1-3Q8IUG1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTAP1-3Q8IUG1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTAP1-3Q8IUG1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRTAP1-3Q8IUG1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTAP1-3Q8IUG1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRTAP1-3Q8IUG1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRTAP1-3Q8IUG1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRTAP1-3Q8IUG1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRTAP1-3Q8IUG1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRTAP1-3Q8IUG1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRTAP1-3Q8IUG1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRTAP1-3Q8IUG1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRTAP1-3Q8IUG1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRTAP1-3Q8IUG1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRTAP1-3Q8IUG1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRTAP1-3Q8IUG1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRTAP1-3Q8IUG1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms