Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF39Q86UA1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF39Q86UA1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF39Q86UA1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF39Q86UA1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF39Q86UA1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF39Q86UA1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF39Q86UA1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF39Q86UA1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF39Q86UA1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF39Q86UA1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF39Q86UA1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF39Q86UA1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF39Q86UA1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF39Q86UA1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF39Q86UA1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF39Q86UA1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF39Q86UA1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF39Q86UA1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF39Q86UA1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF39Q86UA1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF39Q86UA1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF39Q86UA1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF39Q86UA1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF39Q86UA1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF39Q86UA1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF39Q86UA1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF39Q86UA1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF39Q86UA1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF39Q86UA1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF39Q86UA1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF39Q86UA1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRPF39Q86UA1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF39Q86UA1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF39Q86UA1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF39Q86UA1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF39Q86UA1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF39Q86UA1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF39Q86UA1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF39Q86UA1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF39Q86UA1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF39Q86UA1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF39Q86UA1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF39Q86UA1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF39Q86UA1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF39Q86UA1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF39Q86UA1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF39Q86UA1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF39Q86UA1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF39Q86UA1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF39Q86UA1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF39Q86UA1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF39Q86UA1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF39Q86UA1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF39Q86UA1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF39Q86UA1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF39Q86UA1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF39Q86UA1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF39Q86UA1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF39Q86UA1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF39Q86UA1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF39Q86UA1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF39Q86UA1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF39Q86UA1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF39Q86UA1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF39Q86UA1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF39Q86UA1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF39Q86UA1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF39Q86UA1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF39Q86UA1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF39Q86UA1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF39Q86UA1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF39Q86UA1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF39Q86UA1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF39Q86UA1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF39Q86UA1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF39Q86UA1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF39Q86UA1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF39Q86UA1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF39Q86UA1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF39Q86UA1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF39Q86UA1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF39Q86UA1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF39Q86UA1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF39Q86UA1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF39Q86UA1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF39Q86UA1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF39Q86UA1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF39Q86UA1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF39Q86UA1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF39Q86UA1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF39Q86UA1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF39Q86UA1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF39Q86UA1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF39Q86UA1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF39Q86UA1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF39Q86UA1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF39Q86UA1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF39Q86UA1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF39Q86UA1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms