Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOM1L2Q6ZVM7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOM1L2Q6ZVM7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
TOM1L2Q6ZVM7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOM1L2Q6ZVM7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOM1L2Q6ZVM7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOM1L2Q6ZVM7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOM1L2Q6ZVM7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOM1L2Q6ZVM7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
TOM1L2Q6ZVM7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
TOM1L2Q6ZVM7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TOM1L2Q6ZVM7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TOM1L2Q6ZVM7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOM1L2Q6ZVM7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOM1L2Q6ZVM7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOM1L2Q6ZVM7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOM1L2Q6ZVM7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOM1L2Q6ZVM7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOM1L2Q6ZVM7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOM1L2Q6ZVM7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TOM1L2Q6ZVM7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOM1L2Q6ZVM7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOM1L2Q6ZVM7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
TOM1L2Q6ZVM7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOM1L2Q6ZVM7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TOM1L2Q6ZVM7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
TOM1L2Q6ZVM7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
TOM1L2Q6ZVM7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOM1L2Q6ZVM7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOM1L2Q6ZVM7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOM1L2Q6ZVM7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TOM1L2Q6ZVM7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOM1L2Q6ZVM7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TOM1L2Q6ZVM7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
TOM1L2Q6ZVM7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TOM1L2Q6ZVM7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TOM1L2Q6ZVM7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
TOM1L2Q6ZVM7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOM1L2Q6ZVM7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOM1L2Q6ZVM7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOM1L2Q6ZVM7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOM1L2Q6ZVM7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOM1L2Q6ZVM7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TOM1L2Q6ZVM7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TOM1L2Q6ZVM7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TOM1L2Q6ZVM7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
TOM1L2Q6ZVM7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TOM1L2Q6ZVM7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TOM1L2Q6ZVM7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOM1L2Q6ZVM7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TOM1L2Q6ZVM7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
TOM1L2Q6ZVM7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOM1L2Q6ZVM7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOM1L2Q6ZVM7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOM1L2Q6ZVM7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOM1L2Q6ZVM7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
TOM1L2Q6ZVM7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOM1L2Q6ZVM7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOM1L2Q6ZVM7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOM1L2Q6ZVM7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TOM1L2Q6ZVM7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOM1L2Q6ZVM7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOM1L2Q6ZVM7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
TOM1L2Q6ZVM7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOM1L2Q6ZVM7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOM1L2Q6ZVM7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOM1L2Q6ZVM7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOM1L2Q6ZVM7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOM1L2Q6ZVM7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOM1L2Q6ZVM7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOM1L2Q6ZVM7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOM1L2Q6ZVM7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOM1L2Q6ZVM7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOM1L2Q6ZVM7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOM1L2Q6ZVM7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOM1L2Q6ZVM7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOM1L2Q6ZVM7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOM1L2Q6ZVM7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOM1L2Q6ZVM7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOM1L2Q6ZVM7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOM1L2Q6ZVM7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TOM1L2Q6ZVM7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TOM1L2Q6ZVM7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOM1L2Q6ZVM7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOM1L2Q6ZVM7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOM1L2Q6ZVM7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOM1L2Q6ZVM7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOM1L2Q6ZVM7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
TOM1L2Q6ZVM7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOM1L2Q6ZVM7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOM1L2Q6ZVM7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOM1L2Q6ZVM7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOM1L2Q6ZVM7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOM1L2Q6ZVM7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TOM1L2Q6ZVM7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TOM1L2Q6ZVM7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOM1L2Q6ZVM7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOM1L2Q6ZVM7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms