Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TBC1D9Q6ZT07 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TBC1D9Q6ZT07 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TBC1D9Q6ZT07 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TBC1D9Q6ZT07 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TBC1D9Q6ZT07 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TBC1D9Q6ZT07 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TBC1D9Q6ZT07 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TBC1D9Q6ZT07 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TBC1D9Q6ZT07 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TBC1D9Q6ZT07 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TBC1D9Q6ZT07 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TBC1D9Q6ZT07 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TBC1D9Q6ZT07 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TBC1D9Q6ZT07 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TBC1D9Q6ZT07 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TBC1D9Q6ZT07 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TBC1D9Q6ZT07 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TBC1D9Q6ZT07 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TBC1D9Q6ZT07 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TBC1D9Q6ZT07 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TBC1D9Q6ZT07 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TBC1D9Q6ZT07 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TBC1D9Q6ZT07 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TBC1D9Q6ZT07 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TBC1D9Q6ZT07 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TBC1D9Q6ZT07 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TBC1D9Q6ZT07 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TBC1D9Q6ZT07 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TBC1D9Q6ZT07 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TBC1D9Q6ZT07 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TBC1D9Q6ZT07 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TBC1D9Q6ZT07 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TBC1D9Q6ZT07 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TBC1D9Q6ZT07 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TBC1D9Q6ZT07 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TBC1D9Q6ZT07 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TBC1D9Q6ZT07 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TBC1D9Q6ZT07 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TBC1D9Q6ZT07 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TBC1D9Q6ZT07 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TBC1D9Q6ZT07 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TBC1D9Q6ZT07 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TBC1D9Q6ZT07 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TBC1D9Q6ZT07 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TBC1D9Q6ZT07 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TBC1D9Q6ZT07 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TBC1D9Q6ZT07 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TBC1D9Q6ZT07 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TBC1D9Q6ZT07 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TBC1D9Q6ZT07 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TBC1D9Q6ZT07 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TBC1D9Q6ZT07 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TBC1D9Q6ZT07 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TBC1D9Q6ZT07 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TBC1D9Q6ZT07 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TBC1D9Q6ZT07 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TBC1D9Q6ZT07 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
TBC1D9Q6ZT07 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TBC1D9Q6ZT07 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TBC1D9Q6ZT07 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TBC1D9Q6ZT07 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TBC1D9Q6ZT07 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TBC1D9Q6ZT07 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TBC1D9Q6ZT07 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TBC1D9Q6ZT07 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TBC1D9Q6ZT07 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TBC1D9Q6ZT07 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TBC1D9Q6ZT07 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TBC1D9Q6ZT07 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TBC1D9Q6ZT07 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TBC1D9Q6ZT07 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TBC1D9Q6ZT07 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TBC1D9Q6ZT07 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TBC1D9Q6ZT07 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TBC1D9Q6ZT07 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TBC1D9Q6ZT07 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TBC1D9Q6ZT07 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TBC1D9Q6ZT07 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TBC1D9Q6ZT07 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TBC1D9Q6ZT07 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TBC1D9Q6ZT07 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TBC1D9Q6ZT07 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TBC1D9Q6ZT07 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TBC1D9Q6ZT07 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TBC1D9Q6ZT07 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TBC1D9Q6ZT07 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TBC1D9Q6ZT07 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TBC1D9Q6ZT07 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TBC1D9Q6ZT07 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TBC1D9Q6ZT07 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TBC1D9Q6ZT07 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TBC1D9Q6ZT07 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TBC1D9Q6ZT07 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TBC1D9Q6ZT07 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TBC1D9Q6ZT07 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TBC1D9Q6ZT07 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TBC1D9Q6ZT07 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
TBC1D9Q6ZT07 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TBC1D9Q6ZT07 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms