Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00299Q6ZSB3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00299Q6ZSB3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00299Q6ZSB3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00299Q6ZSB3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00299Q6ZSB3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00299Q6ZSB3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00299Q6ZSB3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00299Q6ZSB3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00299Q6ZSB3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00299Q6ZSB3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00299Q6ZSB3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00299Q6ZSB3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00299Q6ZSB3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00299Q6ZSB3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00299Q6ZSB3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00299Q6ZSB3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00299Q6ZSB3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00299Q6ZSB3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00299Q6ZSB3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00299Q6ZSB3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00299Q6ZSB3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00299Q6ZSB3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00299Q6ZSB3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00299Q6ZSB3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00299Q6ZSB3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00299Q6ZSB3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00299Q6ZSB3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00299Q6ZSB3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00299Q6ZSB3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00299Q6ZSB3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00299Q6ZSB3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00299Q6ZSB3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00299Q6ZSB3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00299Q6ZSB3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00299Q6ZSB3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00299Q6ZSB3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00299Q6ZSB3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00299Q6ZSB3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00299Q6ZSB3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00299Q6ZSB3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00299Q6ZSB3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00299Q6ZSB3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00299Q6ZSB3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00299Q6ZSB3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00299Q6ZSB3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00299Q6ZSB3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00299Q6ZSB3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00299Q6ZSB3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00299Q6ZSB3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00299Q6ZSB3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00299Q6ZSB3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00299Q6ZSB3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00299Q6ZSB3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00299Q6ZSB3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00299Q6ZSB3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00299Q6ZSB3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00299Q6ZSB3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00299Q6ZSB3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00299Q6ZSB3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00299Q6ZSB3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00299Q6ZSB3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00299Q6ZSB3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00299Q6ZSB3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00299Q6ZSB3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00299Q6ZSB3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00299Q6ZSB3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00299Q6ZSB3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00299Q6ZSB3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00299Q6ZSB3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00299Q6ZSB3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00299Q6ZSB3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00299Q6ZSB3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00299Q6ZSB3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00299Q6ZSB3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00299Q6ZSB3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00299Q6ZSB3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00299Q6ZSB3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00299Q6ZSB3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00299Q6ZSB3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00299Q6ZSB3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00299Q6ZSB3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00299Q6ZSB3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00299Q6ZSB3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00299Q6ZSB3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00299Q6ZSB3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00299Q6ZSB3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00299Q6ZSB3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00299Q6ZSB3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00299Q6ZSB3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00299Q6ZSB3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00299Q6ZSB3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00299Q6ZSB3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00299Q6ZSB3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00299Q6ZSB3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LINC00299Q6ZSB3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00299Q6ZSB3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00299Q6ZSB3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms