Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRT6

PRR23B, Proline-rich protein 23B, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23BQ6ZRT6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRR23BQ6ZRT6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRR23BQ6ZRT6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRR23BQ6ZRT6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRR23BQ6ZRT6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRR23BQ6ZRT6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRR23BQ6ZRT6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRR23BQ6ZRT6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRR23BQ6ZRT6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRR23BQ6ZRT6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRR23BQ6ZRT6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRR23BQ6ZRT6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRR23BQ6ZRT6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRR23BQ6ZRT6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRR23BQ6ZRT6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRR23BQ6ZRT6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRR23BQ6ZRT6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PRR23BQ6ZRT6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRR23BQ6ZRT6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRR23BQ6ZRT6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PRR23BQ6ZRT6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRR23BQ6ZRT6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRR23BQ6ZRT6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRR23BQ6ZRT6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRR23BQ6ZRT6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRR23BQ6ZRT6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRR23BQ6ZRT6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRR23BQ6ZRT6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRR23BQ6ZRT6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRR23BQ6ZRT6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRR23BQ6ZRT6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRR23BQ6ZRT6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRR23BQ6ZRT6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRR23BQ6ZRT6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRR23BQ6ZRT6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRR23BQ6ZRT6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRR23BQ6ZRT6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PRR23BQ6ZRT6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRR23BQ6ZRT6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRR23BQ6ZRT6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRR23BQ6ZRT6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRR23BQ6ZRT6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRR23BQ6ZRT6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRR23BQ6ZRT6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PRR23BQ6ZRT6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRR23BQ6ZRT6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRR23BQ6ZRT6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRR23BQ6ZRT6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRR23BQ6ZRT6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRR23BQ6ZRT6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRR23BQ6ZRT6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRR23BQ6ZRT6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR23BQ6ZRT6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR23BQ6ZRT6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR23BQ6ZRT6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR23BQ6ZRT6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR23BQ6ZRT6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR23BQ6ZRT6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRR23BQ6ZRT6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRR23BQ6ZRT6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRR23BQ6ZRT6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRR23BQ6ZRT6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRR23BQ6ZRT6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRR23BQ6ZRT6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRR23BQ6ZRT6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRR23BQ6ZRT6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRR23BQ6ZRT6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRR23BQ6ZRT6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRR23BQ6ZRT6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRR23BQ6ZRT6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRR23BQ6ZRT6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRR23BQ6ZRT6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRR23BQ6ZRT6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRR23BQ6ZRT6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRR23BQ6ZRT6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRR23BQ6ZRT6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRR23BQ6ZRT6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRR23BQ6ZRT6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PRR23BQ6ZRT6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PRR23BQ6ZRT6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRR23BQ6ZRT6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRR23BQ6ZRT6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRR23BQ6ZRT6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRR23BQ6ZRT6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRR23BQ6ZRT6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRR23BQ6ZRT6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRR23BQ6ZRT6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRR23BQ6ZRT6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRR23BQ6ZRT6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRR23BQ6ZRT6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRR23BQ6ZRT6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRR23BQ6ZRT6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRR23BQ6ZRT6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRR23BQ6ZRT6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRR23BQ6ZRT6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRR23BQ6ZRT6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRR23BQ6ZRT6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRR23BQ6ZRT6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRR23BQ6ZRT6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRR23BQ6ZRT6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms