Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXS1

PPP1R2P3, Protein phosphatase inhibitor 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R2P3Q6NXS1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPP1R2P3Q6NXS1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP1R2P3Q6NXS1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP1R2P3Q6NXS1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP1R2P3Q6NXS1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP1R2P3Q6NXS1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP1R2P3Q6NXS1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP1R2P3Q6NXS1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP1R2P3Q6NXS1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP1R2P3Q6NXS1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP1R2P3Q6NXS1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP1R2P3Q6NXS1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP1R2P3Q6NXS1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP1R2P3Q6NXS1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP1R2P3Q6NXS1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP1R2P3Q6NXS1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPP1R2P3Q6NXS1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PPP1R2P3Q6NXS1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP1R2P3Q6NXS1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP1R2P3Q6NXS1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP1R2P3Q6NXS1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP1R2P3Q6NXS1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP1R2P3Q6NXS1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP1R2P3Q6NXS1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP1R2P3Q6NXS1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP1R2P3Q6NXS1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP1R2P3Q6NXS1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP1R2P3Q6NXS1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPP1R2P3Q6NXS1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPP1R2P3Q6NXS1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPP1R2P3Q6NXS1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPP1R2P3Q6NXS1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPP1R2P3Q6NXS1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPP1R2P3Q6NXS1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPP1R2P3Q6NXS1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPP1R2P3Q6NXS1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PPP1R2P3Q6NXS1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PPP1R2P3Q6NXS1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PPP1R2P3Q6NXS1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPP1R2P3Q6NXS1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP1R2P3Q6NXS1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP1R2P3Q6NXS1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP1R2P3Q6NXS1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP1R2P3Q6NXS1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPP1R2P3Q6NXS1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPP1R2P3Q6NXS1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP1R2P3Q6NXS1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP1R2P3Q6NXS1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPP1R2P3Q6NXS1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPP1R2P3Q6NXS1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPP1R2P3Q6NXS1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPP1R2P3Q6NXS1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPP1R2P3Q6NXS1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPP1R2P3Q6NXS1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP1R2P3Q6NXS1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP1R2P3Q6NXS1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP1R2P3Q6NXS1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP1R2P3Q6NXS1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R2P3Q6NXS1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R2P3Q6NXS1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R2P3Q6NXS1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R2P3Q6NXS1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R2P3Q6NXS1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP1R2P3Q6NXS1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP1R2P3Q6NXS1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R2P3Q6NXS1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R2P3Q6NXS1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R2P3Q6NXS1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R2P3Q6NXS1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R2P3Q6NXS1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R2P3Q6NXS1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R2P3Q6NXS1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP1R2P3Q6NXS1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP1R2P3Q6NXS1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R2P3Q6NXS1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R2P3Q6NXS1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R2P3Q6NXS1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R2P3Q6NXS1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R2P3Q6NXS1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R2P3Q6NXS1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP1R2P3Q6NXS1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R2P3Q6NXS1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R2P3Q6NXS1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R2P3Q6NXS1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R2P3Q6NXS1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R2P3Q6NXS1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R2P3Q6NXS1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R2P3Q6NXS1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R2P3Q6NXS1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPP1R2P3Q6NXS1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPP1R2P3Q6NXS1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPP1R2P3Q6NXS1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPP1R2P3Q6NXS1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPP1R2P3Q6NXS1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R2P3Q6NXS1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R2P3Q6NXS1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R2P3Q6NXS1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP1R2P3Q6NXS1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP1R2P3Q6NXS1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP1R2P3Q6NXS1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms