Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
VIRMAQ69YN4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
VIRMAQ69YN4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
VIRMAQ69YN4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
VIRMAQ69YN4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
VIRMAQ69YN4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
VIRMAQ69YN4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
VIRMAQ69YN4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
VIRMAQ69YN4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
VIRMAQ69YN4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
VIRMAQ69YN4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
VIRMAQ69YN4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
VIRMAQ69YN4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
VIRMAQ69YN4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
VIRMAQ69YN4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
VIRMAQ69YN4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
VIRMAQ69YN4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
VIRMAQ69YN4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
VIRMAQ69YN4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
VIRMAQ69YN4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
VIRMAQ69YN4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
VIRMAQ69YN4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
VIRMAQ69YN4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
VIRMAQ69YN4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
VIRMAQ69YN4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
VIRMAQ69YN4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
VIRMAQ69YN4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
VIRMAQ69YN4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
VIRMAQ69YN4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
VIRMAQ69YN4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
VIRMAQ69YN4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
VIRMAQ69YN4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
VIRMAQ69YN4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
VIRMAQ69YN4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
VIRMAQ69YN4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
VIRMAQ69YN4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
VIRMAQ69YN4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
VIRMAQ69YN4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
VIRMAQ69YN4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
VIRMAQ69YN4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
VIRMAQ69YN4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
VIRMAQ69YN4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
VIRMAQ69YN4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
VIRMAQ69YN4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
VIRMAQ69YN4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
VIRMAQ69YN4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
VIRMAQ69YN4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
VIRMAQ69YN4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
VIRMAQ69YN4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
VIRMAQ69YN4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
VIRMAQ69YN4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
VIRMAQ69YN4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
VIRMAQ69YN4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
VIRMAQ69YN4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
VIRMAQ69YN4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
VIRMAQ69YN4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
VIRMAQ69YN4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
VIRMAQ69YN4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
VIRMAQ69YN4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
VIRMAQ69YN4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
VIRMAQ69YN4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
VIRMAQ69YN4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
VIRMAQ69YN4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
VIRMAQ69YN4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
VIRMAQ69YN4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
VIRMAQ69YN4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
VIRMAQ69YN4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
VIRMAQ69YN4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
VIRMAQ69YN4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
VIRMAQ69YN4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
VIRMAQ69YN4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
VIRMAQ69YN4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
VIRMAQ69YN4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
VIRMAQ69YN4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
VIRMAQ69YN4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
VIRMAQ69YN4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
VIRMAQ69YN4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
VIRMAQ69YN4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
VIRMAQ69YN4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
VIRMAQ69YN4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
VIRMAQ69YN4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
VIRMAQ69YN4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
VIRMAQ69YN4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
VIRMAQ69YN4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
VIRMAQ69YN4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
VIRMAQ69YN4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
VIRMAQ69YN4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
VIRMAQ69YN4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
VIRMAQ69YN4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
VIRMAQ69YN4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
VIRMAQ69YN4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
VIRMAQ69YN4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
VIRMAQ69YN4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
VIRMAQ69YN4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
VIRMAQ69YN4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
VIRMAQ69YN4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
VIRMAQ69YN4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
VIRMAQ69YN4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
VIRMAQ69YN4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
VIRMAQ69YN4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms