Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCTD16Q68DU8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCTD16Q68DU8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCTD16Q68DU8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCTD16Q68DU8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCTD16Q68DU8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCTD16Q68DU8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCTD16Q68DU8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCTD16Q68DU8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCTD16Q68DU8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCTD16Q68DU8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCTD16Q68DU8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCTD16Q68DU8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCTD16Q68DU8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCTD16Q68DU8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
KCTD16Q68DU8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCTD16Q68DU8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCTD16Q68DU8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCTD16Q68DU8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCTD16Q68DU8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCTD16Q68DU8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KCTD16Q68DU8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCTD16Q68DU8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCTD16Q68DU8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCTD16Q68DU8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KCTD16Q68DU8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCTD16Q68DU8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCTD16Q68DU8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCTD16Q68DU8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCTD16Q68DU8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCTD16Q68DU8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCTD16Q68DU8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCTD16Q68DU8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCTD16Q68DU8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCTD16Q68DU8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCTD16Q68DU8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCTD16Q68DU8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCTD16Q68DU8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCTD16Q68DU8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCTD16Q68DU8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCTD16Q68DU8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
KCTD16Q68DU8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KCTD16Q68DU8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KCTD16Q68DU8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCTD16Q68DU8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCTD16Q68DU8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCTD16Q68DU8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCTD16Q68DU8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KCTD16Q68DU8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCTD16Q68DU8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCTD16Q68DU8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCTD16Q68DU8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCTD16Q68DU8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCTD16Q68DU8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCTD16Q68DU8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCTD16Q68DU8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCTD16Q68DU8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCTD16Q68DU8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCTD16Q68DU8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCTD16Q68DU8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCTD16Q68DU8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCTD16Q68DU8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCTD16Q68DU8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
KCTD16Q68DU8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCTD16Q68DU8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCTD16Q68DU8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCTD16Q68DU8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCTD16Q68DU8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCTD16Q68DU8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCTD16Q68DU8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCTD16Q68DU8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCTD16Q68DU8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCTD16Q68DU8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCTD16Q68DU8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCTD16Q68DU8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCTD16Q68DU8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCTD16Q68DU8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCTD16Q68DU8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCTD16Q68DU8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCTD16Q68DU8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCTD16Q68DU8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCTD16Q68DU8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCTD16Q68DU8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCTD16Q68DU8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCTD16Q68DU8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCTD16Q68DU8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCTD16Q68DU8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCTD16Q68DU8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCTD16Q68DU8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCTD16Q68DU8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCTD16Q68DU8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCTD16Q68DU8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCTD16Q68DU8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCTD16Q68DU8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCTD16Q68DU8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCTD16Q68DU8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCTD16Q68DU8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCTD16Q68DU8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCTD16Q68DU8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCTD16Q68DU8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms