Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CROCCQ5TZA2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CROCCQ5TZA2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CROCCQ5TZA2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CROCCQ5TZA2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CROCCQ5TZA2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CROCCQ5TZA2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CROCCQ5TZA2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CROCCQ5TZA2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CROCCQ5TZA2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CROCCQ5TZA2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CROCCQ5TZA2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CROCCQ5TZA2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CROCCQ5TZA2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CROCCQ5TZA2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CROCCQ5TZA2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CROCCQ5TZA2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CROCCQ5TZA2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CROCCQ5TZA2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CROCCQ5TZA2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CROCCQ5TZA2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CROCCQ5TZA2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CROCCQ5TZA2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CROCCQ5TZA2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CROCCQ5TZA2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CROCCQ5TZA2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CROCCQ5TZA2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CROCCQ5TZA2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CROCCQ5TZA2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CROCCQ5TZA2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CROCCQ5TZA2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CROCCQ5TZA2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CROCCQ5TZA2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CROCCQ5TZA2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CROCCQ5TZA2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CROCCQ5TZA2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CROCCQ5TZA2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CROCCQ5TZA2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CROCCQ5TZA2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CROCCQ5TZA2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CROCCQ5TZA2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CROCCQ5TZA2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CROCCQ5TZA2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CROCCQ5TZA2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CROCCQ5TZA2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CROCCQ5TZA2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CROCCQ5TZA2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CROCCQ5TZA2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CROCCQ5TZA2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CROCCQ5TZA2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CROCCQ5TZA2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CROCCQ5TZA2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CROCCQ5TZA2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CROCCQ5TZA2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CROCCQ5TZA2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CROCCQ5TZA2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CROCCQ5TZA2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CROCCQ5TZA2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CROCCQ5TZA2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CROCCQ5TZA2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CROCCQ5TZA2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CROCCQ5TZA2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CROCCQ5TZA2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CROCCQ5TZA2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CROCCQ5TZA2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CROCCQ5TZA2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CROCCQ5TZA2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CROCCQ5TZA2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CROCCQ5TZA2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CROCCQ5TZA2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CROCCQ5TZA2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CROCCQ5TZA2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CROCCQ5TZA2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CROCCQ5TZA2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CROCCQ5TZA2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CROCCQ5TZA2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CROCCQ5TZA2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CROCCQ5TZA2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CROCCQ5TZA2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CROCCQ5TZA2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CROCCQ5TZA2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CROCCQ5TZA2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CROCCQ5TZA2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CROCCQ5TZA2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms