Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP40Q5TG30 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGAP40Q5TG30 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGAP40Q5TG30 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGAP40Q5TG30 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGAP40Q5TG30 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP40Q5TG30 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP40Q5TG30 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP40Q5TG30 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP40Q5TG30 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGAP40Q5TG30 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGAP40Q5TG30 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP40Q5TG30 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP40Q5TG30 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGAP40Q5TG30 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGAP40Q5TG30 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGAP40Q5TG30 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGAP40Q5TG30 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGAP40Q5TG30 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP40Q5TG30 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGAP40Q5TG30 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGAP40Q5TG30 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP40Q5TG30 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP40Q5TG30 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP40Q5TG30 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGAP40Q5TG30 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP40Q5TG30 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms