Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CAMSAP1Q5T5Y3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CAMSAP1Q5T5Y3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CAMSAP1Q5T5Y3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CAMSAP1Q5T5Y3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CAMSAP1Q5T5Y3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
CAMSAP1Q5T5Y3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CAMSAP1Q5T5Y3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CAMSAP1Q5T5Y3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CAMSAP1Q5T5Y3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
CAMSAP1Q5T5Y3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
CAMSAP1Q5T5Y3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CAMSAP1Q5T5Y3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
CAMSAP1Q5T5Y3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CAMSAP1Q5T5Y3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CAMSAP1Q5T5Y3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CAMSAP1Q5T5Y3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CAMSAP1Q5T5Y3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CAMSAP1Q5T5Y3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CAMSAP1Q5T5Y3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
CAMSAP1Q5T5Y3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CAMSAP1Q5T5Y3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CAMSAP1Q5T5Y3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CAMSAP1Q5T5Y3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CAMSAP1Q5T5Y3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CAMSAP1Q5T5Y3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CAMSAP1Q5T5Y3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CAMSAP1Q5T5Y3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CAMSAP1Q5T5Y3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CAMSAP1Q5T5Y3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CAMSAP1Q5T5Y3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CAMSAP1Q5T5Y3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CAMSAP1Q5T5Y3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CAMSAP1Q5T5Y3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CAMSAP1Q5T5Y3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CAMSAP1Q5T5Y3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CAMSAP1Q5T5Y3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CAMSAP1Q5T5Y3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CAMSAP1Q5T5Y3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CAMSAP1Q5T5Y3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CAMSAP1Q5T5Y3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CAMSAP1Q5T5Y3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CAMSAP1Q5T5Y3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CAMSAP1Q5T5Y3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CAMSAP1Q5T5Y3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CAMSAP1Q5T5Y3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CAMSAP1Q5T5Y3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CAMSAP1Q5T5Y3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CAMSAP1Q5T5Y3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CAMSAP1Q5T5Y3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CAMSAP1Q5T5Y3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CAMSAP1Q5T5Y3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CAMSAP1Q5T5Y3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CAMSAP1Q5T5Y3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CAMSAP1Q5T5Y3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CAMSAP1Q5T5Y3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CAMSAP1Q5T5Y3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CAMSAP1Q5T5Y3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CAMSAP1Q5T5Y3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CAMSAP1Q5T5Y3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms