Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC92Q53HC0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC92Q53HC0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC92Q53HC0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC92Q53HC0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC92Q53HC0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC92Q53HC0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC92Q53HC0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC92Q53HC0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC92Q53HC0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC92Q53HC0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC92Q53HC0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC92Q53HC0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC92Q53HC0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC92Q53HC0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC92Q53HC0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC92Q53HC0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC92Q53HC0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC92Q53HC0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC92Q53HC0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC92Q53HC0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC92Q53HC0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC92Q53HC0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC92Q53HC0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC92Q53HC0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC92Q53HC0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC92Q53HC0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC92Q53HC0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC92Q53HC0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC92Q53HC0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC92Q53HC0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC92Q53HC0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC92Q53HC0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC92Q53HC0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC92Q53HC0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC92Q53HC0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC92Q53HC0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC92Q53HC0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC92Q53HC0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC92Q53HC0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC92Q53HC0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC92Q53HC0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC92Q53HC0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC92Q53HC0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC92Q53HC0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC92Q53HC0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC92Q53HC0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC92Q53HC0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC92Q53HC0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC92Q53HC0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC92Q53HC0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC92Q53HC0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC92Q53HC0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC92Q53HC0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC92Q53HC0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC92Q53HC0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC92Q53HC0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC92Q53HC0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC92Q53HC0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC92Q53HC0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC92Q53HC0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC92Q53HC0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC92Q53HC0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC92Q53HC0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC92Q53HC0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC92Q53HC0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC92Q53HC0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC92Q53HC0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC92Q53HC0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC92Q53HC0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC92Q53HC0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC92Q53HC0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC92Q53HC0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC92Q53HC0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC92Q53HC0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC92Q53HC0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC92Q53HC0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC92Q53HC0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC92Q53HC0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC92Q53HC0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms