Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC58Q4VC31 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC58Q4VC31 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC58Q4VC31 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC58Q4VC31 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC58Q4VC31 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC58Q4VC31 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC58Q4VC31 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC58Q4VC31 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC58Q4VC31 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC58Q4VC31 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC58Q4VC31 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC58Q4VC31 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC58Q4VC31 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC58Q4VC31 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC58Q4VC31 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC58Q4VC31 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC58Q4VC31 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC58Q4VC31 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC58Q4VC31 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC58Q4VC31 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC58Q4VC31 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC58Q4VC31 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC58Q4VC31 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC58Q4VC31 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC58Q4VC31 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC58Q4VC31 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC58Q4VC31 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC58Q4VC31 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC58Q4VC31 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC58Q4VC31 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC58Q4VC31 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC58Q4VC31 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC58Q4VC31 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC58Q4VC31 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC58Q4VC31 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC58Q4VC31 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC58Q4VC31 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC58Q4VC31 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC58Q4VC31 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC58Q4VC31 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC58Q4VC31 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC58Q4VC31 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC58Q4VC31 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC58Q4VC31 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC58Q4VC31 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC58Q4VC31 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC58Q4VC31 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC58Q4VC31 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC58Q4VC31 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC58Q4VC31 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC58Q4VC31 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC58Q4VC31 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC58Q4VC31 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC58Q4VC31 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC58Q4VC31 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC58Q4VC31 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC58Q4VC31 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC58Q4VC31 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC58Q4VC31 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC58Q4VC31 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC58Q4VC31 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC58Q4VC31 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC58Q4VC31 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC58Q4VC31 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC58Q4VC31 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC58Q4VC31 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC58Q4VC31 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC58Q4VC31 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC58Q4VC31 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC58Q4VC31 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC58Q4VC31 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC58Q4VC31 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC58Q4VC31 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC58Q4VC31 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC58Q4VC31 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC58Q4VC31 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC58Q4VC31 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC58Q4VC31 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC58Q4VC31 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC58Q4VC31 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC58Q4VC31 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC58Q4VC31 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms