Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPO4Q2I0M5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPO4Q2I0M5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPO4Q2I0M5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPO4Q2I0M5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RSPO4Q2I0M5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPO4Q2I0M5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPO4Q2I0M5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPO4Q2I0M5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RSPO4Q2I0M5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPO4Q2I0M5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPO4Q2I0M5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPO4Q2I0M5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPO4Q2I0M5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPO4Q2I0M5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPO4Q2I0M5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPO4Q2I0M5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPO4Q2I0M5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPO4Q2I0M5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPO4Q2I0M5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPO4Q2I0M5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPO4Q2I0M5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPO4Q2I0M5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPO4Q2I0M5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPO4Q2I0M5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPO4Q2I0M5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPO4Q2I0M5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPO4Q2I0M5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPO4Q2I0M5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPO4Q2I0M5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RSPO4Q2I0M5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RSPO4Q2I0M5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPO4Q2I0M5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPO4Q2I0M5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RSPO4Q2I0M5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RSPO4Q2I0M5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
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