Protein–RNA interactions for Protein: Q29RF7

PDS5A, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5AQ29RF7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDS5AQ29RF7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDS5AQ29RF7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDS5AQ29RF7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDS5AQ29RF7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PDS5AQ29RF7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PDS5AQ29RF7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PDS5AQ29RF7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDS5AQ29RF7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDS5AQ29RF7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDS5AQ29RF7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDS5AQ29RF7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDS5AQ29RF7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDS5AQ29RF7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDS5AQ29RF7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDS5AQ29RF7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDS5AQ29RF7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
PDS5AQ29RF7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PDS5AQ29RF7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5AQ29RF7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PDS5AQ29RF7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDS5AQ29RF7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDS5AQ29RF7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDS5AQ29RF7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDS5AQ29RF7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDS5AQ29RF7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PDS5AQ29RF7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PDS5AQ29RF7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDS5AQ29RF7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDS5AQ29RF7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PDS5AQ29RF7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDS5AQ29RF7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5AQ29RF7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDS5AQ29RF7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDS5AQ29RF7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDS5AQ29RF7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5AQ29RF7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDS5AQ29RF7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PDS5AQ29RF7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
PDS5AQ29RF7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDS5AQ29RF7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDS5AQ29RF7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PDS5AQ29RF7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PDS5AQ29RF7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDS5AQ29RF7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDS5AQ29RF7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDS5AQ29RF7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDS5AQ29RF7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PDS5AQ29RF7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PDS5AQ29RF7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PDS5AQ29RF7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PDS5AQ29RF7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PDS5AQ29RF7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PDS5AQ29RF7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PDS5AQ29RF7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDS5AQ29RF7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDS5AQ29RF7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDS5AQ29RF7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDS5AQ29RF7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDS5AQ29RF7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PDS5AQ29RF7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
PDS5AQ29RF7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PDS5AQ29RF7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
PDS5AQ29RF7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PDS5AQ29RF7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PDS5AQ29RF7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PDS5AQ29RF7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PDS5AQ29RF7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDS5AQ29RF7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDS5AQ29RF7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDS5AQ29RF7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PDS5AQ29RF7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PDS5AQ29RF7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDS5AQ29RF7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDS5AQ29RF7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDS5AQ29RF7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDS5AQ29RF7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDS5AQ29RF7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDS5AQ29RF7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PDS5AQ29RF7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PDS5AQ29RF7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PDS5AQ29RF7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PDS5AQ29RF7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PDS5AQ29RF7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms