Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF56Q15929 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF56Q15929 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF56Q15929 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF56Q15929 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF56Q15929 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF56Q15929 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF56Q15929 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF56Q15929 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF56Q15929 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF56Q15929 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF56Q15929 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF56Q15929 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF56Q15929 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF56Q15929 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF56Q15929 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF56Q15929 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF56Q15929 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF56Q15929 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF56Q15929 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF56Q15929 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF56Q15929 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF56Q15929 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF56Q15929 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF56Q15929 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF56Q15929 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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ZNF56Q15929 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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ZNF56Q15929 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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ZNF56Q15929 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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ZNF56Q15929 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF56Q15929 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF56Q15929 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF56Q15929 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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ZNF56Q15929 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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ZNF56Q15929 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF56Q15929 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF56Q15929 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF56Q15929 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF56Q15929 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF56Q15929 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF56Q15929 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF56Q15929 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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ZNF56Q15929 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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ZNF56Q15929 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF56Q15929 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF56Q15929 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF56Q15929 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF56Q15929 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF56Q15929 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF56Q15929 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF56Q15929 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF56Q15929 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF56Q15929 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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