Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNA1EQ15878 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1EQ15878 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1EQ15878 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA1EQ15878 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA1EQ15878 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA1EQ15878 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1EQ15878 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNA1EQ15878 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA1EQ15878 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA1EQ15878 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA1EQ15878 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1EQ15878 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1EQ15878 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1EQ15878 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1EQ15878 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1EQ15878 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1EQ15878 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1EQ15878 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1EQ15878 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1EQ15878 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1EQ15878 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1EQ15878 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1EQ15878 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1EQ15878 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1EQ15878 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1EQ15878 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1EQ15878 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1EQ15878 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1EQ15878 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1EQ15878 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1EQ15878 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1EQ15878 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1EQ15878 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1EQ15878 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1EQ15878 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA1EQ15878 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA1EQ15878 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA1EQ15878 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA1EQ15878 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA1EQ15878 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA1EQ15878 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA1EQ15878 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1EQ15878 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1EQ15878 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1EQ15878 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1EQ15878 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1EQ15878 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1EQ15878 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1EQ15878 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1EQ15878 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1EQ15878 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1EQ15878 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1EQ15878 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1EQ15878 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1EQ15878 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1EQ15878 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNA1EQ15878 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNA1EQ15878 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1EQ15878 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA1EQ15878 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA1EQ15878 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA1EQ15878 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1EQ15878 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1EQ15878 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA1EQ15878 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA1EQ15878 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1EQ15878 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1EQ15878 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1EQ15878 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA1EQ15878 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA1EQ15878 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA1EQ15878 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA1EQ15878 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA1EQ15878 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA1EQ15878 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1EQ15878 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1EQ15878 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1EQ15878 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA1EQ15878 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA1EQ15878 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA1EQ15878 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1EQ15878 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA1EQ15878 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA1EQ15878 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA1EQ15878 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA1EQ15878 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1EQ15878 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1EQ15878 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA1EQ15878 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA1EQ15878 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1EQ15878 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1EQ15878 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA1EQ15878 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA1EQ15878 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA1EQ15878 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA1EQ15878 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA1EQ15878 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA1EQ15878 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA1EQ15878 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms