Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD8Q15843 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD8Q15843 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD8Q15843 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD8Q15843 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD8Q15843 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD8Q15843 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD8Q15843 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD8Q15843 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD8Q15843 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD8Q15843 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD8Q15843 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD8Q15843 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD8Q15843 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD8Q15843 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD8Q15843 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD8Q15843 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD8Q15843 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD8Q15843 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8Q15843 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8Q15843 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8Q15843 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8Q15843 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD8Q15843 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD8Q15843 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD8Q15843 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD8Q15843 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD8Q15843 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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