Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RRS1Q15050 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RRS1Q15050 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
RRS1Q15050 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RRS1Q15050 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RRS1Q15050 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RRS1Q15050 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
RRS1Q15050 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RRS1Q15050 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RRS1Q15050 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RRS1Q15050 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RRS1Q15050 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RRS1Q15050 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
RRS1Q15050 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RRS1Q15050 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RRS1Q15050 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
RRS1Q15050 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RRS1Q15050 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RRS1Q15050 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
RRS1Q15050 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RRS1Q15050 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RRS1Q15050 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
RRS1Q15050 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
RRS1Q15050 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RRS1Q15050 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RRS1Q15050 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RRS1Q15050 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RRS1Q15050 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RRS1Q15050 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
RRS1Q15050 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RRS1Q15050 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RRS1Q15050 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RRS1Q15050 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RRS1Q15050 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RRS1Q15050 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RRS1Q15050 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RRS1Q15050 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RRS1Q15050 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RRS1Q15050 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RRS1Q15050 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RRS1Q15050 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
RRS1Q15050 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RRS1Q15050 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RRS1Q15050 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RRS1Q15050 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RRS1Q15050 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RRS1Q15050 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RRS1Q15050 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RRS1Q15050 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RRS1Q15050 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RRS1Q15050 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RRS1Q15050 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
RRS1Q15050 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RRS1Q15050 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
RRS1Q15050 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
RRS1Q15050 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RRS1Q15050 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RRS1Q15050 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RRS1Q15050 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RRS1Q15050 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RRS1Q15050 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
RRS1Q15050 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RRS1Q15050 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RRS1Q15050 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RRS1Q15050 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RRS1Q15050 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RRS1Q15050 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RRS1Q15050 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RRS1Q15050 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RRS1Q15050 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RRS1Q15050 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RRS1Q15050 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RRS1Q15050 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RRS1Q15050 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RRS1Q15050 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RRS1Q15050 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RRS1Q15050 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RRS1Q15050 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
RRS1Q15050 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
RRS1Q15050 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
RRS1Q15050 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RRS1Q15050 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RRS1Q15050 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RRS1Q15050 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RRS1Q15050 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
RRS1Q15050 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RRS1Q15050 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RRS1Q15050 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RRS1Q15050 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RRS1Q15050 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
RRS1Q15050 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37■■■■□ 3.51
RRS1Q15050 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RRS1Q15050 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RRS1Q15050 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RRS1Q15050 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RRS1Q15050 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RRS1Q15050 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RRS1Q15050 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RRS1Q15050 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
RRS1Q15050 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms