Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SCN5AQ14524 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCN5AQ14524 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCN5AQ14524 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN5AQ14524 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN5AQ14524 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN5AQ14524 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCN5AQ14524 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN5AQ14524 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCN5AQ14524 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCN5AQ14524 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN5AQ14524 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCN5AQ14524 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN5AQ14524 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SCN5AQ14524 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SCN5AQ14524 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN5AQ14524 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN5AQ14524 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN5AQ14524 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN5AQ14524 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN5AQ14524 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN5AQ14524 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCN5AQ14524 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN5AQ14524 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCN5AQ14524 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCN5AQ14524 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCN5AQ14524 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCN5AQ14524 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCN5AQ14524 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCN5AQ14524 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCN5AQ14524 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN5AQ14524 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN5AQ14524 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms