Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPRIN1Q14444 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPRIN1Q14444 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPRIN1Q14444 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPRIN1Q14444 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPRIN1Q14444 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPRIN1Q14444 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPRIN1Q14444 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPRIN1Q14444 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPRIN1Q14444 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPRIN1Q14444 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPRIN1Q14444 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPRIN1Q14444 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPRIN1Q14444 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPRIN1Q14444 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPRIN1Q14444 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPRIN1Q14444 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPRIN1Q14444 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPRIN1Q14444 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPRIN1Q14444 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPRIN1Q14444 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPRIN1Q14444 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPRIN1Q14444 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPRIN1Q14444 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPRIN1Q14444 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPRIN1Q14444 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPRIN1Q14444 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPRIN1Q14444 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAPRIN1Q14444 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPRIN1Q14444 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPRIN1Q14444 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPRIN1Q14444 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPRIN1Q14444 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPRIN1Q14444 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPRIN1Q14444 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPRIN1Q14444 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPRIN1Q14444 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPRIN1Q14444 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPRIN1Q14444 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPRIN1Q14444 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPRIN1Q14444 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPRIN1Q14444 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPRIN1Q14444 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPRIN1Q14444 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPRIN1Q14444 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPRIN1Q14444 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPRIN1Q14444 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPRIN1Q14444 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPRIN1Q14444 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPRIN1Q14444 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPRIN1Q14444 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPRIN1Q14444 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPRIN1Q14444 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPRIN1Q14444 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPRIN1Q14444 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPRIN1Q14444 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPRIN1Q14444 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPRIN1Q14444 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPRIN1Q14444 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPRIN1Q14444 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPRIN1Q14444 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPRIN1Q14444 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPRIN1Q14444 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPRIN1Q14444 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPRIN1Q14444 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPRIN1Q14444 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPRIN1Q14444 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPRIN1Q14444 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPRIN1Q14444 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPRIN1Q14444 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPRIN1Q14444 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPRIN1Q14444 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPRIN1Q14444 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPRIN1Q14444 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPRIN1Q14444 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPRIN1Q14444 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPRIN1Q14444 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPRIN1Q14444 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPRIN1Q14444 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPRIN1Q14444 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPRIN1Q14444 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPRIN1Q14444 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPRIN1Q14444 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPRIN1Q14444 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPRIN1Q14444 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPRIN1Q14444 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPRIN1Q14444 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPRIN1Q14444 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPRIN1Q14444 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPRIN1Q14444 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPRIN1Q14444 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPRIN1Q14444 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAPRIN1Q14444 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPRIN1Q14444 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPRIN1Q14444 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPRIN1Q14444 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPRIN1Q14444 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPRIN1Q14444 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPRIN1Q14444 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPRIN1Q14444 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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