Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNTB1Q13884 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNTB1Q13884 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNTB1Q13884 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNTB1Q13884 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNTB1Q13884 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNTB1Q13884 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNTB1Q13884 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNTB1Q13884 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNTB1Q13884 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNTB1Q13884 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNTB1Q13884 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNTB1Q13884 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNTB1Q13884 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNTB1Q13884 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNTB1Q13884 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNTB1Q13884 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNTB1Q13884 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNTB1Q13884 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNTB1Q13884 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNTB1Q13884 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNTB1Q13884 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNTB1Q13884 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNTB1Q13884 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNTB1Q13884 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNTB1Q13884 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNTB1Q13884 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNTB1Q13884 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNTB1Q13884 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNTB1Q13884 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNTB1Q13884 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNTB1Q13884 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNTB1Q13884 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNTB1Q13884 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNTB1Q13884 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNTB1Q13884 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNTB1Q13884 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNTB1Q13884 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNTB1Q13884 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNTB1Q13884 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNTB1Q13884 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNTB1Q13884 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNTB1Q13884 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNTB1Q13884 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNTB1Q13884 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNTB1Q13884 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNTB1Q13884 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNTB1Q13884 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNTB1Q13884 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNTB1Q13884 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNTB1Q13884 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNTB1Q13884 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNTB1Q13884 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTB1Q13884 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTB1Q13884 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNTB1Q13884 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNTB1Q13884 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNTB1Q13884 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNTB1Q13884 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTB1Q13884 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTB1Q13884 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTB1Q13884 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTB1Q13884 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTB1Q13884 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTB1Q13884 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTB1Q13884 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTB1Q13884 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTB1Q13884 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNTB1Q13884 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNTB1Q13884 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNTB1Q13884 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNTB1Q13884 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNTB1Q13884 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNTB1Q13884 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNTB1Q13884 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNTB1Q13884 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNTB1Q13884 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNTB1Q13884 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNTB1Q13884 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNTB1Q13884 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNTB1Q13884 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNTB1Q13884 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNTB1Q13884 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNTB1Q13884 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNTB1Q13884 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNTB1Q13884 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNTB1Q13884 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNTB1Q13884 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNTB1Q13884 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNTB1Q13884 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNTB1Q13884 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNTB1Q13884 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNTB1Q13884 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNTB1Q13884 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNTB1Q13884 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNTB1Q13884 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNTB1Q13884 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SNTB1Q13884 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNTB1Q13884 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNTB1Q13884 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms