Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRSF6Q13247 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRSF6Q13247 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRSF6Q13247 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRSF6Q13247 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRSF6Q13247 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRSF6Q13247 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRSF6Q13247 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SRSF6Q13247 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRSF6Q13247 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRSF6Q13247 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRSF6Q13247 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRSF6Q13247 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRSF6Q13247 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SRSF6Q13247 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRSF6Q13247 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRSF6Q13247 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRSF6Q13247 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRSF6Q13247 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRSF6Q13247 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRSF6Q13247 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRSF6Q13247 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRSF6Q13247 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SRSF6Q13247 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SRSF6Q13247 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRSF6Q13247 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRSF6Q13247 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRSF6Q13247 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRSF6Q13247 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRSF6Q13247 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRSF6Q13247 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRSF6Q13247 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRSF6Q13247 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRSF6Q13247 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SRSF6Q13247 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SRSF6Q13247 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SRSF6Q13247 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRSF6Q13247 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRSF6Q13247 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRSF6Q13247 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRSF6Q13247 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRSF6Q13247 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRSF6Q13247 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRSF6Q13247 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRSF6Q13247 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRSF6Q13247 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRSF6Q13247 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRSF6Q13247 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRSF6Q13247 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF6Q13247 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF6Q13247 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF6Q13247 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF6Q13247 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRSF6Q13247 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRSF6Q13247 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRSF6Q13247 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRSF6Q13247 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRSF6Q13247 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRSF6Q13247 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SRSF6Q13247 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRSF6Q13247 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRSF6Q13247 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRSF6Q13247 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SRSF6Q13247 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRSF6Q13247 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRSF6Q13247 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRSF6Q13247 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRSF6Q13247 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRSF6Q13247 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRSF6Q13247 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SRSF6Q13247 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRSF6Q13247 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRSF6Q13247 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRSF6Q13247 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRSF6Q13247 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRSF6Q13247 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRSF6Q13247 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRSF6Q13247 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRSF6Q13247 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRSF6Q13247 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRSF6Q13247 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRSF6Q13247 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRSF6Q13247 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRSF6Q13247 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRSF6Q13247 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRSF6Q13247 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
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