Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRSF5Q13243 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRSF5Q13243 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRSF5Q13243 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRSF5Q13243 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRSF5Q13243 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRSF5Q13243 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SRSF5Q13243 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRSF5Q13243 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SRSF5Q13243 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRSF5Q13243 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
SRSF5Q13243 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRSF5Q13243 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRSF5Q13243 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRSF5Q13243 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRSF5Q13243 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRSF5Q13243 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SRSF5Q13243 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRSF5Q13243 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRSF5Q13243 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRSF5Q13243 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRSF5Q13243 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRSF5Q13243 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRSF5Q13243 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRSF5Q13243 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRSF5Q13243 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRSF5Q13243 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SRSF5Q13243 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRSF5Q13243 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRSF5Q13243 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRSF5Q13243 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRSF5Q13243 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
SRSF5Q13243 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRSF5Q13243 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRSF5Q13243 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SRSF5Q13243 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRSF5Q13243 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRSF5Q13243 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRSF5Q13243 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRSF5Q13243 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRSF5Q13243 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRSF5Q13243 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRSF5Q13243 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SRSF5Q13243 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRSF5Q13243 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRSF5Q13243 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SRSF5Q13243 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRSF5Q13243 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SRSF5Q13243 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRSF5Q13243 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRSF5Q13243 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRSF5Q13243 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SRSF5Q13243 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRSF5Q13243 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRSF5Q13243 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRSF5Q13243 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRSF5Q13243 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRSF5Q13243 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRSF5Q13243 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SRSF5Q13243 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRSF5Q13243 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRSF5Q13243 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRSF5Q13243 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRSF5Q13243 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRSF5Q13243 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRSF5Q13243 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRSF5Q13243 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRSF5Q13243 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRSF5Q13243 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRSF5Q13243 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRSF5Q13243 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRSF5Q13243 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRSF5Q13243 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRSF5Q13243 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SRSF5Q13243 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRSF5Q13243 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRSF5Q13243 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRSF5Q13243 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRSF5Q13243 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRSF5Q13243 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRSF5Q13243 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRSF5Q13243 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRSF5Q13243 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRSF5Q13243 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRSF5Q13243 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRSF5Q13243 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRSF5Q13243 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRSF5Q13243 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRSF5Q13243 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRSF5Q13243 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRSF5Q13243 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRSF5Q13243 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRSF5Q13243 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRSF5Q13243 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRSF5Q13243 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRSF5Q13243 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRSF5Q13243 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRSF5Q13243 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRSF5Q13243 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRSF5Q13243 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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