Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAF1BQ13112 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAF1BQ13112 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAF1BQ13112 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAF1BQ13112 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHAF1BQ13112 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAF1BQ13112 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAF1BQ13112 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1BQ13112 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1BQ13112 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAF1BQ13112 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHAF1BQ13112 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHAF1BQ13112 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHAF1BQ13112 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAF1BQ13112 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1BQ13112 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1BQ13112 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1BQ13112 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1BQ13112 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1BQ13112 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1BQ13112 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1BQ13112 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1BQ13112 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAF1BQ13112 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAF1BQ13112 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1BQ13112 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1BQ13112 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1BQ13112 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1BQ13112 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAF1BQ13112 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAF1BQ13112 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAF1BQ13112 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAF1BQ13112 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1BQ13112 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1BQ13112 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAF1BQ13112 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAF1BQ13112 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAF1BQ13112 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAF1BQ13112 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAF1BQ13112 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAF1BQ13112 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAF1BQ13112 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1BQ13112 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1BQ13112 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1BQ13112 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAF1BQ13112 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAF1BQ13112 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAF1BQ13112 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAF1BQ13112 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAF1BQ13112 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAF1BQ13112 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAF1BQ13112 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAF1BQ13112 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAF1BQ13112 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAF1BQ13112 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAF1BQ13112 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAF1BQ13112 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAF1BQ13112 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAF1BQ13112 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAF1BQ13112 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAF1BQ13112 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1BQ13112 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1BQ13112 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAF1BQ13112 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHAF1BQ13112 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAF1BQ13112 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1BQ13112 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1BQ13112 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAF1BQ13112 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAF1BQ13112 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAF1BQ13112 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1BQ13112 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1BQ13112 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1BQ13112 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAF1BQ13112 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1BQ13112 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1BQ13112 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1BQ13112 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1BQ13112 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1BQ13112 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1BQ13112 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAF1BQ13112 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAF1BQ13112 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1BQ13112 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1BQ13112 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1BQ13112 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAF1BQ13112 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1BQ13112 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1BQ13112 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1BQ13112 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1BQ13112 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1BQ13112 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAF1BQ13112 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAF1BQ13112 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1BQ13112 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAF1BQ13112 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHAF1BQ13112 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAF1BQ13112 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAF1BQ13112 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAF1BQ13112 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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