Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MKRN3Q13064 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MKRN3Q13064 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MKRN3Q13064 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
MKRN3Q13064 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MKRN3Q13064 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MKRN3Q13064 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MKRN3Q13064 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
MKRN3Q13064 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
MKRN3Q13064 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MKRN3Q13064 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
MKRN3Q13064 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
MKRN3Q13064 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MKRN3Q13064 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MKRN3Q13064 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MKRN3Q13064 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MKRN3Q13064 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MKRN3Q13064 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MKRN3Q13064 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MKRN3Q13064 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
MKRN3Q13064 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MKRN3Q13064 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MKRN3Q13064 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
MKRN3Q13064 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MKRN3Q13064 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MKRN3Q13064 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MKRN3Q13064 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MKRN3Q13064 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
MKRN3Q13064 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
MKRN3Q13064 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
MKRN3Q13064 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MKRN3Q13064 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MKRN3Q13064 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MKRN3Q13064 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MKRN3Q13064 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MKRN3Q13064 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MKRN3Q13064 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
MKRN3Q13064 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
MKRN3Q13064 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
MKRN3Q13064 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
MKRN3Q13064 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MKRN3Q13064 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
MKRN3Q13064 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MKRN3Q13064 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MKRN3Q13064 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MKRN3Q13064 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
MKRN3Q13064 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
MKRN3Q13064 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MKRN3Q13064 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MKRN3Q13064 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
MKRN3Q13064 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MKRN3Q13064 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MKRN3Q13064 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MKRN3Q13064 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
MKRN3Q13064 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MKRN3Q13064 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
MKRN3Q13064 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MKRN3Q13064 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MKRN3Q13064 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MKRN3Q13064 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MKRN3Q13064 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MKRN3Q13064 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MKRN3Q13064 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MKRN3Q13064 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MKRN3Q13064 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MKRN3Q13064 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MKRN3Q13064 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MKRN3Q13064 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
MKRN3Q13064 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MKRN3Q13064 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MKRN3Q13064 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MKRN3Q13064 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MKRN3Q13064 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MKRN3Q13064 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MKRN3Q13064 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MKRN3Q13064 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MKRN3Q13064 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
MKRN3Q13064 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MKRN3Q13064 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MKRN3Q13064 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MKRN3Q13064 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MKRN3Q13064 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MKRN3Q13064 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MKRN3Q13064 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
MKRN3Q13064 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
MKRN3Q13064 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MKRN3Q13064 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MKRN3Q13064 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MKRN3Q13064 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MKRN3Q13064 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MKRN3Q13064 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MKRN3Q13064 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MKRN3Q13064 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MKRN3Q13064 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
MKRN3Q13064 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MKRN3Q13064 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MKRN3Q13064 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MKRN3Q13064 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MKRN3Q13064 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MKRN3Q13064 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
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