Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC16Q13042 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC16Q13042 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC16Q13042 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC16Q13042 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC16Q13042 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC16Q13042 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC16Q13042 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC16Q13042 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDC16Q13042 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC16Q13042 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC16Q13042 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC16Q13042 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC16Q13042 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC16Q13042 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC16Q13042 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC16Q13042 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC16Q13042 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC16Q13042 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC16Q13042 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC16Q13042 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC16Q13042 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC16Q13042 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC16Q13042 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC16Q13042 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC16Q13042 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC16Q13042 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC16Q13042 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC16Q13042 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC16Q13042 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC16Q13042 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC16Q13042 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDC16Q13042 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDC16Q13042 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC16Q13042 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC16Q13042 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC16Q13042 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC16Q13042 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC16Q13042 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC16Q13042 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC16Q13042 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC16Q13042 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC16Q13042 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC16Q13042 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC16Q13042 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC16Q13042 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC16Q13042 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC16Q13042 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC16Q13042 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC16Q13042 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC16Q13042 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC16Q13042 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC16Q13042 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC16Q13042 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC16Q13042 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC16Q13042 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC16Q13042 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC16Q13042 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC16Q13042 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC16Q13042 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC16Q13042 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC16Q13042 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC16Q13042 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC16Q13042 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC16Q13042 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC16Q13042 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC16Q13042 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC16Q13042 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC16Q13042 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC16Q13042 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC16Q13042 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC16Q13042 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC16Q13042 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC16Q13042 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC16Q13042 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC16Q13042 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC16Q13042 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC16Q13042 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC16Q13042 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC16Q13042 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC16Q13042 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC16Q13042 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC16Q13042 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC16Q13042 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC16Q13042 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC16Q13042 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC16Q13042 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC16Q13042 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC16Q13042 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC16Q13042 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC16Q13042 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC16Q13042 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC16Q13042 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC16Q13042 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC16Q13042 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC16Q13042 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC16Q13042 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC16Q13042 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC16Q13042 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC16Q13042 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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