Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIK3Q13003 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIK3Q13003 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIK3Q13003 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK3Q13003 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK3Q13003 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIK3Q13003 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIK3Q13003 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIK3Q13003 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GRIK3Q13003 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIK3Q13003 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIK3Q13003 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIK3Q13003 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIK3Q13003 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIK3Q13003 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIK3Q13003 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIK3Q13003 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIK3Q13003 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIK3Q13003 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIK3Q13003 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIK3Q13003 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIK3Q13003 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIK3Q13003 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIK3Q13003 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIK3Q13003 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIK3Q13003 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIK3Q13003 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIK3Q13003 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIK3Q13003 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GRIK3Q13003 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GRIK3Q13003 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIK3Q13003 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIK3Q13003 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIK3Q13003 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIK3Q13003 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GRIK3Q13003 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIK3Q13003 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIK3Q13003 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIK3Q13003 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIK3Q13003 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIK3Q13003 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIK3Q13003 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIK3Q13003 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIK3Q13003 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIK3Q13003 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIK3Q13003 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIK3Q13003 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIK3Q13003 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIK3Q13003 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIK3Q13003 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIK3Q13003 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIK3Q13003 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIK3Q13003 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIK3Q13003 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIK3Q13003 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIK3Q13003 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIK3Q13003 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIK3Q13003 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIK3Q13003 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIK3Q13003 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIK3Q13003 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIK3Q13003 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIK3Q13003 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIK3Q13003 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIK3Q13003 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GRIK3Q13003 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIK3Q13003 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIK3Q13003 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIK3Q13003 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIK3Q13003 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIK3Q13003 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIK3Q13003 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIK3Q13003 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIK3Q13003 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIK3Q13003 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIK3Q13003 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIK3Q13003 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIK3Q13003 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIK3Q13003 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIK3Q13003 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIK3Q13003 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIK3Q13003 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIK3Q13003 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIK3Q13003 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIK3Q13003 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIK3Q13003 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIK3Q13003 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIK3Q13003 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIK3Q13003 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIK3Q13003 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIK3Q13003 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIK3Q13003 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIK3Q13003 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIK3Q13003 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GRIK3Q13003 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GRIK3Q13003 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIK3Q13003 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIK3Q13003 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIK3Q13003 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIK3Q13003 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
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