Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCB1Q12824 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCB1Q12824 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCB1Q12824 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCB1Q12824 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCB1Q12824 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCB1Q12824 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCB1Q12824 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCB1Q12824 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCB1Q12824 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCB1Q12824 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCB1Q12824 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCB1Q12824 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCB1Q12824 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCB1Q12824 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCB1Q12824 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCB1Q12824 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCB1Q12824 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCB1Q12824 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCB1Q12824 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCB1Q12824 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCB1Q12824 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCB1Q12824 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCB1Q12824 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCB1Q12824 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCB1Q12824 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCB1Q12824 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMARCB1Q12824 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCB1Q12824 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SMARCB1Q12824 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCB1Q12824 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCB1Q12824 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCB1Q12824 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCB1Q12824 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCB1Q12824 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCB1Q12824 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCB1Q12824 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCB1Q12824 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMARCB1Q12824 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCB1Q12824 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCB1Q12824 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCB1Q12824 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCB1Q12824 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCB1Q12824 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCB1Q12824 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCB1Q12824 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCB1Q12824 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCB1Q12824 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCB1Q12824 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCB1Q12824 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCB1Q12824 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCB1Q12824 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCB1Q12824 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCB1Q12824 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCB1Q12824 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCB1Q12824 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCB1Q12824 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCB1Q12824 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCB1Q12824 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCB1Q12824 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCB1Q12824 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCB1Q12824 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCB1Q12824 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCB1Q12824 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCB1Q12824 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCB1Q12824 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCB1Q12824 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCB1Q12824 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCB1Q12824 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCB1Q12824 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCB1Q12824 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCB1Q12824 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SMARCB1Q12824 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCB1Q12824 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCB1Q12824 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCB1Q12824 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCB1Q12824 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCB1Q12824 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCB1Q12824 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCB1Q12824 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCB1Q12824 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCB1Q12824 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCB1Q12824 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
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