Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNB3Q05901 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNB3Q05901 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNB3Q05901 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHRNB3Q05901 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNB3Q05901 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNB3Q05901 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNB3Q05901 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNB3Q05901 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNB3Q05901 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNB3Q05901 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNB3Q05901 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNB3Q05901 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNB3Q05901 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNB3Q05901 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNB3Q05901 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNB3Q05901 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNB3Q05901 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNB3Q05901 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNB3Q05901 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNB3Q05901 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNB3Q05901 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNB3Q05901 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNB3Q05901 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNB3Q05901 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNB3Q05901 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNB3Q05901 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNB3Q05901 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNB3Q05901 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNB3Q05901 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNB3Q05901 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNB3Q05901 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNB3Q05901 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRNB3Q05901 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRNB3Q05901 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNB3Q05901 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNB3Q05901 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB3Q05901 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB3Q05901 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNB3Q05901 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNB3Q05901 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB3Q05901 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNB3Q05901 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNB3Q05901 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNB3Q05901 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNB3Q05901 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB3Q05901 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB3Q05901 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB3Q05901 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNB3Q05901 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNB3Q05901 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNB3Q05901 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNB3Q05901 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNB3Q05901 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNB3Q05901 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNB3Q05901 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHRNB3Q05901 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHRNB3Q05901 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNB3Q05901 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNB3Q05901 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNB3Q05901 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNB3Q05901 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNB3Q05901 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNB3Q05901 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNB3Q05901 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNB3Q05901 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNB3Q05901 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNB3Q05901 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNB3Q05901 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNB3Q05901 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNB3Q05901 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNB3Q05901 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNB3Q05901 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNB3Q05901 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNB3Q05901 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNB3Q05901 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNB3Q05901 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNB3Q05901 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNB3Q05901 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNB3Q05901 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNB3Q05901 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNB3Q05901 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNB3Q05901 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNB3Q05901 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNB3Q05901 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNB3Q05901 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNB3Q05901 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNB3Q05901 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNB3Q05901 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNB3Q05901 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNB3Q05901 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNB3Q05901 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNB3Q05901 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNB3Q05901 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNB3Q05901 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNB3Q05901 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNB3Q05901 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNB3Q05901 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNB3Q05901 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNB3Q05901 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 303.9 ms